由於社經環境的變遷與自由貿易協定的簽訂，使得農產品外銷量大增，為應運訂單需求品質與產量都必須受到嚴密的控制與管理。因此如何提升農產業的企業化營運能力已成為當前的發展趨勢。加上近年投入農業的年輕族群增加，由於缺乏實務的農作經驗，他們更需要完整的知識系統以協助他們進行規劃與決策。

     在日本所使用的決策支援系統分為兩種類型，一是短期決策支援系統用於每日農業活動中；另一種是長期決策支援系統，規劃時程較長通常是以一年或是一個栽種週期為區間，做出栽種時期內最適作物、工作時間、施藥計畫及施肥規劃等安排。

     長期決策支援系統FAPS是一種風險管理預測系統，協助農民針對農業活動中許多的不穩定因素進行耕種規劃及決策支援的系統。在1995年前所開發的版本僅是於專業人士使用，後考慮農業從事人員不一定對於數學模組及規劃了解透徹，故從1995年開始建置非專業人士應用軟體版本。由於FAPS系統需要一定的資料量以產出更豐富的報表，因此在FAPS系統開發後才進行FAPS-DB的建置工作。藉由FAPS-DB所囊括的資料可產出16餘種圖表以做為決策輔助之用。圖表類型包括：現金流、收支平衡表、投入資材列表、農機具設備需求單及工作時間表…等。

     FAPS分為單機版與線上版兩種使用方式。單機版在1996至2001年間所發出的軟體安裝光碟已達600片，主要的使用單位為農業推廣單位佔所有使用者的26%；其次是地方實驗中心佔21%；大專院校與他教育單位佔11%；農民4%；私人企業4%；國家級研究單位4%及中央政府單位4%。上列統計資料中，農民僅佔4%但這些是代表「直接」使用軟體的農民比例。

     由於日本農民年齡層較高，以致於大多數農民是藉由農業推廣單位或是實驗中心的輔導後「間接」使用該系統，因此隱含於其中的農民使用者並未出現在統計資料中。網路版的使用率在2007年4月至2008年4的13個月中，年頁面點擊率達60萬次。

     除了應用於農業及耕作計畫之外（以上佔所有使用比率90.4%）尚有9.6%的應用是使用於政策分析或制訂等方向。

     另一個長期決策支援系統是NAPASS，系統建置始於1983年，目前已運作達25年是協助農產品市場資訊分析的系統。資料包含每日農產品市場價格及蔬果存量，涵蓋日本53家主要的批發市場及156種蔬果品項，歷史資料最早可追溯至1977年。

     短期決策支援系統Noyaku-Navi是一個農藥警示及記錄系統，在評估農藥量是否過量的同時也將施藥相關資訊一同記錄下來。系統初次建置始於2004年，初期系統資料庫僅包含農藥，目前最新的系統包含農藥、添加物及藥品等。利用可照相手機或是光學字元辨識器材，讀取農業化學藥品包裝外的條碼後，即可輸入時間、灑藥部位、灑藥原因（病蟲害照片）、灑藥者姓名及灑藥方式於農民的手持設備中。以上資料傳回後端系統，系統即會針對以上資料與法律標準對照做出判定。判定後無農藥誤用或是過量之虞，系統便會自動將施藥資訊記錄入資料庫中。此系統對於不闇電腦操作的農民而言，是極為簡單的輔助工具。從栽種到包裝運輸乃至零售消費者，每個階段都可送出資料做出判定確認藥品的使用無虞。一般農民對於短期決策支援系統的認同度和依賴性較高，也願意付費使用此系統（日本農民以五塊美金的年費付費使用此系統）。主要是因為農藥誤用或施用過當將造成產品無法銷售，農民本身還會遭受罰款與停止生產，對農民的收入產生直接的影響。目前已有超過一萬一千名的日本農民使用這個系統。