農委會表示，有關 阿里山森林鐵路小火車事故原因， 經嘉義地檢署勘驗後表示並無超載、亦無人為操作疏失；森林專家前往現場 鑑識研判， 此次斷裂意外無法以人力檢測及預防，屬自然現象。目前，該會對於本次 事故傷者及罹難者不論陸客及台灣旅客，均一視同仁盡力給予照護 ；另有關阿里山森林鐵路後續處理方式，農委會林務局將於一星期內，籌組阿里山森林鐵路總體檢團隊，從安全、地質、生態、林業、技術（鐵路機務、工務、運務）及人文歷史等層面加以整體評估，作為後續營運及改善之參據，並在確認安全無虞之情形下才會復駛。

　　農委會說明，本 次事故傷者及罹難者之陸客家屬，經由交通部觀光局及海基會等相關單位協助，已於本日清晨陸續抵台， 趕抵嘉義探視受傷及不幸罹難的家人。首批青島團已於 4 月 29 日 凌晨 2 時抵台後直赴嘉義，於 6 時左右到達，林務局嘉義林區管理處楊宏志處長在飯店等候予以接待。其他四川等 3 團，亦將陸續抵台。總計 4 月 29 日 有家屬及工作人員 56 人抵台， 4 月 30 日 預計約有 40 人抵台，每團抵台之陸客家屬，農委會林務局嘉義林區管理處均指派專人全程陪同，協助相關事宜。

　　針對事故傷者，農委會林務局嘉義林區管理處業分別於 聖馬爾定醫院、嘉義榮民、嘉義基督教、大林慈濟、嘉義長庚、署立嘉義醫院及高雄市立大同醫院等七個醫院， 由員工編組成立「一人一戶」服務團。 在 每家醫療院所派駐專人，建立住院名冊，以一對一方式，負責與醫院、旅行社、傷者及照護家屬間之聯繫作業，同時也與醫院密切聯繫配合受傷者之實際需求，安排看護照護事宜。截 至 4 月 28 日 中午 12 時止， 計有 46 人出院，尚有 67 人分於 聖馬爾定醫院、嘉義榮民、嘉義基督教、大林慈濟、嘉義長庚、署立嘉義醫院等六個醫院治療 。另針對事故罹難者，嘉義林區管理處已於嘉義市殯儀館設置靈堂，每日指派 主管級人員於現場協助家屬，後續將與家屬協調後辦理公祭。

　　農委會指出，目前對罹難者及傷者慰問金部分， 該會正依規劃陸續致送罹難者 20 萬元，重傷者 10 萬元，輕傷者 5 萬元，目前已致送 38 人，其餘陸續致送中。另 已與保險公司確認罹難者之遊客團體傷害險 410 萬元出險理賠等事宜 ， 傷者則將協助受傷部分之後續醫療，相關醫療費用由保險費支出，保險費不足部分，則由農委會負擔。

　　另有關森林鐵路未來營運主體部分，副主委胡興華表示，前已於 100 年 4 月 19 日與交通部次長張邱春共同召開「研商阿里山森林鐵路後續營運主體相關事宜會議」，會中決議對於森林鐵路未來營運主體將朝「委託營運」、「移轉管理」、「成立專責單位」三方案之方向研議，並由農業委員會林務局與交通部臺鐵局儘速再為研商，於 3 個月後將辦理情形提報交通部與農委會跨部會會議討論，務於 100 年底前確定後續營運主體。