針對民進黨總統參選人蔡英文接見動物保護團體時，所提出的動物保護業務方向，農委會表示，有關推動寵物登記及犬貓絕育等，皆為該會目前工作重點。該會於 98 年起透過修正動物保護法及加強稽查，強化飼主責任建立及寵物業管理工作，以杜絕非法繁殖及棄養犬隻行為，各種作為係以「源頭管理」達到保護動物的施政目標。其中寵物登記部分， 100 年間迄今已新增登記超過 8 萬隻，較歷年平均新增 6 萬隻大幅成長；犬貓絕育數量近 3 年平均每年近 4 萬隻，亦較近 10 年平均之 1.5 萬隻顯著增加，顯見農委會推動動物保護已見成效。

落實源頭管理 致力逐年減少流浪犬數量

　　農委會表示，有關推動寵物植入晶片辦理登記部分，在 97 年後，每年都以新增登記 6 萬隻的數量穩定成長， 100 年度在該會實施加強稽查計畫之後，已使 100 年截至目前為止新增登記數量已逾 8 萬隻，全國寵物登記數量並累計逾 96 萬隻，登記率逾 7 成。推廣犬貓絕育的數量，也由近 10 年的年平均 1 萬 5 千隻增加到近 3 年 ( 97 、 98 、 99) 的年平均近 4 萬隻。

　　農委會進一步指出，強化寵物業管理是該會近年修法及執法重點， 98 及 99 年陸續修訂相關法令，除推動寵物業查核評鑑制度外， 100 年度並訂定「加強查緝非法寵物繁殖買賣業者計畫」，要求地方政府擴大稽查範圍及提高緝查頻度，務提升寵物業飼養動物之福利。該會將持續推動源頭管理工作，以達逐年減少流浪犬數量之目標。在經濟動物部分，農委會也在 97 年以後訂定了運送及人道屠宰的規定，規範相關從業人員須參加講習及取得證照，讓經濟動物的生產更符合動物福利。

持續與地方政府及動保團體合作推動動物保護工作

　　農委會表示，動物保護預算大部分都用在補助地方政府落實執行動物保護法，例如人力、收容所設施、推廣絕育等，五都成立後其動物保護主管機關之層級提升，人力及經費也都增加，農委會除肯定五都的作法之外，亦將持續與各縣市政府合作，加強與動保團體的溝通，共同提升我國的動物福利水準。