（一）穩健推動清除豬瘟（CSF）
　　本部規劃實施三階段豬瘟撲滅計畫，2024年度內依序進入第二階段及第三階段，逐步穩健推動豬瘟相關防疫工作，承繼2023年1月起階段性停止注射豬瘟疫苗、2023年7月1日起全面拔針等進程，2024年結合5個家畜保健中心擴大豬瘟檢測量能，並持續全面性監測養豬場、化製場斃死豬、屠宰場淘汰種豬、野豬、棄置豬屍及海漂豬屍等，監測結果養豬場豬隻、上市肉豬豬瘟抗體均已衰退，化製場化製數量異常場回溯調查均未發現豬瘟案例及病毒活動跡象，已符合世界動物衛生組織（WOAH）陸生動物衛生法典所列「豬瘟非疫國」要件，爰於2024年8月23日向WOAH提出申請，倘獲審查核可，有望於2025年獲WOAH認證為「豬瘟非疫國」。

（二）持續防堵非洲豬瘟跨境傳播
　　2018年8月中國大陸發生非洲豬瘟，行政院旋即成立非洲豬瘟中央災害應變中心，透過嚴格邊境查驗，對於來自非洲豬瘟高風險國家或地區入境旅客，以X光機執行百分百手提與託運行李檢查，全力防堵病毒入侵，針對通報首例發生非洲豬瘟疫情國家，立即將其列入非洲豬瘟高風險國家名單強化管制措施，以積極保障我國養豬產業。
　　迄2024年底，亞洲已有19個國家發生疫情，經分析近年邊境查獲非法攜入肉製品檢驗結果，顯示亞洲地區國家非洲豬瘟疫情仍然嚴峻，且有基因重組型非洲豬瘟病毒擴散風險。在執行相關防檢疫措施下，目前檢驗國內豬隻結果，包括海漂豬屍、棄置死豬、化製場淘汰病弱豬及獵捕野豬等，迄未檢出非洲豬瘟陽性，且已於2024年10月31日獲得世界動物衛生組織認可為非洲豬瘟自我宣告非疫國。

（三）提升有害生物監測與診斷鑑定技術
　　因應氣候變遷，本部建置植物有害生物戰情中心，至2024年累計完成建置秋行軍蟲及果瓜實蠅等20種病蟲害展示儀表板。2024年更新優化4種稻熱病預警模組，及新增飛蝨遷入預警地圖；另持續更新44種作物圖層，優化與新增夜蛾及果實蠅類害蟲自動化監測模組，累計完成20組自動監測陷阱布置，以強化整體決策效能。另2024年針對近年新興病害，建立草莓角斑病、甜瓜壞疽斑點病毒及媒介真菌診斷鑑定技術。
　　近年來監測水稻抗病品種如「台農84號」、「台農81號」及「台南20號」等，已陸續發現對部分稻熱病菌株產生抗病性下降趨勢；針對夏秋季青蔥捲葉型炭疽病，2024年已完成田間試驗，結果顯示四氯異苯嚃、嘉賜銅、貝芬同及賽普護汰寧等能顯著降低發病度。

（四）強化屠宰衛生安全檢查與驗證
　　為維護國產肉品衛生安全，2024年屠宰衛生檢查人員在本部監督下，至全國177場屠宰場執行屠宰衛生檢查（包括56場家畜屠宰場、120場家禽屠宰場及1場畜禽屠宰場），共檢查家畜751萬餘頭，家禽4億1,292萬餘隻。同時督導地方政府積極執行違法屠宰查緝工作，且於每年重要節日（春節、端午、中秋）前辦理全國查緝及不預警查核，2024年計查緝1,742場次，查獲違法屠宰35件，銷燬家畜2頭與家禽1,964隻。
　　另為推動屠宰場現代化及肉品冷鏈升級，本部持續鼓勵平均規模以上屠宰場申請「屠宰場肉品衛生安全管制系統」（HACCP）認證，迄2024年底已有家畜屠宰場10場及家禽屠宰場17場共27場取得屠宰場HACCP驗證。2024年我國活豬、豬肉及相關產品出口量為2,838公噸，產值約7億元。

（五）加強禽流感防疫
　　2024年全球H5N1亞型高病原性家禽流行性感冒疫情持續嚴峻，為降低禽流感疫情對家禽產業產生危害，本部依據疾病風險規劃防疫措施，阻斷病毒傳播鏈，使疫情高峰由原本每年12月至翌年1月，延後至2至3月，待4月起氣溫升高即可降低病毒傳播效率。2024年確診案例數計41例，撲殺家禽約57萬隻。我國案例數連續5年皆控制於60例以下，與國際疫情比較相對穩定，疫情呈現穩定控制趨勢。

（六）嚴防國外重要疫病蟲害入侵
　　為防範境外重大動植物疾病入侵我國，本部2024年執行輸入植物檢疫21萬2,000批，輸入動物檢疫20萬1,719批，檢疫犬組偵測查獲違規農產品逾5.7公噸，銷燬走私肉類產品2萬8,100公斤及活動物1,679隻。另針對澳大利亞發生之番茄褐皺果病毒（ToBRFV）及加拿大發生之歐洲櫻桃果實蠅（Rhagoletis cerasi）等95項重要疫情資訊，採行強化檢疫措施。

　　監測進口百合種球之病毒PlAMV與ArMV計70件，均未檢出病毒。另自進口茄科種子中，檢出14批含TYLCV及PSTVd。於金門進行光肩星天牛、馬鈴薯蠹蛾及非洲行軍蟲等入侵高風險害蟲偵查，均未偵獲。

　　本部持續派員赴輸出國執行輸出前檢疫處理及產地查證，包括泰國、日本、韓國、紐西蘭、智利、秘魯、荷蘭及美國等，以確認輸出國落實相關有害生物管理措施。