農委會表示，依據「畜牧法」規定，養豬場得以焚化、掩埋或委託化製之方式處理斃死豬。又95年11月養豬調查統計，養豬戶約有1萬2千餘戶，其中有7,600餘場養豬場與化製場簽訂委託代處理合約，另所餘 4,600餘場多屬飼養50頭以下之小養豬戶，其豬隻死亡數量不多，大多於養豬場內採焚化或掩埋方式處理斃死豬，故並無該媒體所報導「全台一萬多家養豬戶，也只有六成加入合法監控的廢棄物清理體系，4千豬場死豬無控管」之情事。

　　農委會表示，該會一向重視畜產品之衛生安全，並將安全農業列為該會本（96）年度施政之最優先工作，該會強調防範斃死豬非法流供食用之政策以及打擊不法與除惡務盡之決心，並未有所改變。該會並於最後呼籲，全國養豬業者亦應自律自清，除依法做好自身養豬場斃死豬之處理外，並請踴躍提出檢舉，使不肖業者無所遁形，確保國產豬肉之衛生安全。