88 風災期間，屏東縣高樹鄉因舊寮堤防潰決，沖毀屏東農田水利會舊寮舊圳上游 2 公里灌溉圳路，影響下游水利會灌區約 800 公頃農田無法灌溉，經行政院農委會協調屏東農田水利會緊急開挖河道引進溪水，並以大型抽水機抽水應急，終於在 11 日晚間恢復通水，解除準備復耕農民的缺水危機。

　　農委會表示，屏東縣高樹鄉新豐村在這次莫拉克颱風期間受創嚴重，不但堤防潰堤沖毀流失約 385 公頃私有農地，屏東農田水利會之舊寮舊圳取水口以下 2 公里灌溉圳路亦遭沖毀，影響下游水利會灌區六個村落 800 餘公頃農田無法灌溉。該會農田水利處於 9 月 23 及 28 日派員至現場會勘後，決定採直接於荖濃溪抽水供灌，並協調屏東水利會應於經濟部水利署第七河川局完成搶修堤防護岸後 3 日內 ( 即 10 月 12 日前 ) ，完成抽水設施供灌。

　　農委會強調，本月 8 日第七河川局完成臨時堤防強固工程後，屏東農田水利會高樹工作站立即調派怪手從行水區挖掘 100 多公尺臨時河道及儲水池，並於現地施作抽水機臨時平台，同時向水利署借調 2 台大型抽水機抽水輸往下游圳路，終於在 11 日晚間正式供水，適時解決下游 800 公頃農田缺水危機。這項臨時供水措施，採 24 小時全天候抽水，預定持續到舊寮舊圳復建工程完工時停止。

　　農委會表示，後續復建工程之進行，屏東農田水利會已規劃在河川局護岸堤防旁埋設灌溉管線，預計可於明 (99) 年 2 月完工，恢復風災前正常供灌機能。