有關報載「金馬農產輸台不設防，為中鋪路」，農委會本 (5) 日表示，政府應金馬民眾所請，自去 (98) 年 11 月 1 日 起原所有 266 項小三通優惠進口項目都已取消，金馬地區農產品進口項目完全比照台灣本島，金馬地區在 11 、 12 月也沒有從中國大陸進口任何農畜產品。學者所謂「取消產地證明，等於幫中國農產品開後門」的說法，與事實完全不符，該篇報導明顯誤導民眾。

農委會指出，金馬小三通係為照顧離島地區需求，於 90 年元月開始試辦，允許比台灣本島多開放 266 項農產品，該等產品只限金馬地區使用，不得中轉台灣本島。惟為防杜小三通帶來病蟲害，該會訂定「植物或植物產品運出金門馬祖地區檢查辦法」，規範離島自產農產品應檢附貨源證明，經檢查合格後始得運台。當地民眾多年來反映檢查作業造成不便，經縣政府提出申請，該會爰於去年 10 月 30 日 廢止該辦法，同步取消了包括落花生等 266 項農產品的相對進口優惠。

依據金門港口報關資料，去年 1 至 10 月間廠商計報運了包括落花生、高麗菜、白菜、蘿蔔、花椰菜、青花菜、紅蘿蔔、豌豆等多項小三通優惠項目共 300 餘公噸， 11 月後則無任何農畜產品報關記錄。至報導質疑 11 月間仍有落花生進口，經該會查證該 63 公噸落花生早於 10 月下旬報運進口，由於海關統計資料庫係以審結日期登錄，才顯示在 11 月的統計資料，絕非報導所說「去年 11 月中國花生仍持續進口」。

農委會強調，馬總統早已宣示在任內絕不開放 830 項中國大陸農產品的承諾，向以農民權益為第一考量，至小三通取消檢查更與政府管制 830 項農產品政策無關。至於金馬地區若擬自中國大陸進口農產品，其管制及防疫檢疫規格完全比照台灣辦理；此外，該會亦將持續加強離島地區輸出入檢疫，並辦理病蟲害疫情監測，以確保我國農業生產安全。