行政院農業委員會表示，針對報載兩岸一旦簽署 ECFA ，臺灣糧食會遭受中共掌控，臺灣糧食安全體系將崩潰一節，該會特予澄清，國內不會因簽訂 ECFA 而開放 小麥、玉米等 830 項大陸農產品進口，且政府 透過活化休耕田，鼓勵種植進口量大的雜糧作物，並鼓勵消費國產農產品，以 提高糧食自給率 。

　　農委會說明，為保護農民權益，兩岸經濟協議不談農產品開放及降稅問題。因此，政府將繼續管制中國大陸稻米、小麥、玉米及大豆等共計 830 項農產品進口。目前國內小麥、大豆及玉米等大宗穀物主要由美國、巴西等生產大國供應，未來兩岸簽署經濟協議，不會新增開放項目，亦不致產生臺灣糧食安全由大陸操控情形。

　　農委會表示，民國 70 年以熱量計算的綜合糧食自給率為 53.8% ， 90 年為 34.8% ，至 97 年降為 32.4% ，主要是由於國內經濟發展，受飲食西化與多樣化影響，國人膳食習慣改變，肉類及蛋類之消費量增加，相對增加進口飼料穀物的需求；主食方面稻米消費比重降低，麵粉比重提高趨勢。 91 年加入世界貿易組織後，稻米方面，每年必須進口 14 萬餘公噸糙米，約占國內年消費量 1 成，也進一步降低糧食自給率。

　　農委會強調，為提高國內糧食自給率，目前正推動「小地主大佃農」政策，活化休耕田鼓勵復耕措施，獎勵種植飼料玉米、牧草、豆類等具進口替代性產品。至於在掌握安全存量方面，目前政府公糧掌握 38 萬公噸糙米，高於安全存量標準 30 萬公噸糙米，且 99 年第 1 期稻作陸續收穫中，國內稻米供應安全無虞。

　　農委會表示，近年來國人膳食結構反映出碳水化合物攝取不足，脂肪則明顯過量。該會鼓勵國人應多消費國產食米，調整國人膳食結構朝理想狀況邁進。另該會將推動「在地生產，在地消費」觀念導入國人膳食習慣中，減少食物里程，同時為節能減碳盡一份心力。