1. 積極參與國際漁業組織，爭取漁業權益

   在互惠原則下，拓展國際漁業合作，目前與27個國家達成漁業合作協議，以紓解我漁場不足。為維護我國遠洋漁業權益，善盡船旗國責任，積極參與國際漁業組織，範圍涵蓋三大洋，包括中西太平洋漁業委員會(WCPFC)、大西洋鮪類資源保育委員會(ICCAT)等6個組織，並透過國際間的漁業合作，提升我國在該等組織之參與層面，落實資源保育管理目的。為爭取漁業權益，95年將參與全球性組織會議15次，並召開3項國際漁業組織會議。

2. 推動責任漁業及調整遠洋漁業規模

   為因應大西洋鮪類資源保育委員會(ICCAT)第19屆年會大幅限縮我國大目鮪配額，實施減船措施，除94年已減少59艘大目鮪作業漁船外，95年將再減少鮪延繩釣漁船101艘，同時輔導42艘大目鮪漁船於95年2月15日返國停航，並派遣執法及科學觀察員隨船觀察及辦理港口檢查，防制大西洋大目鮪漁獲轉載，同時，辦理24公尺以下中小型延繩釣漁船監控與回報機制。此外，研擬「遠洋漁業整備方案」及權宜船漁業管理相關法規，強化管控非法未報告未受規範(IUU)漁船等漁業管理作為，向國際展示我國履行國際鮪類養護管理之決心。

3. 漁業談判與護漁措施

   在漁業談判方面，第15次台日漁業會談已於94年7月間舉行，達成朝向「劃定排除雙方法令適用水域範圍」之共識，但仍需繼續協商，並已於94年10月及95年1月舉行2次預備性會談，雙方預定於95年3月間召開第16次台日漁業會談，妥善解決台日經濟海域重疊爭議，期能儘速簽署漁業協定。另於94年9月簽定「台菲漁業合作瞭解備忘錄」，繼續朝建立防範越界捕魚之機制努力。

   在護漁措施方面，本會將持續協請海巡署依「政府護漁標準作業程序」派遣船艦護漁，保障漁船(民)作業安全，且漁民如遇有緊急事故，可透過漁業通訊電台或直接通報海巡署即時派遣船艦就近協助；在台日菲簽署漁業協定之前，於重疊專屬經濟海域作業之20噸以上未滿100噸延繩釣漁船，已輔導安裝船位回報器(VMS)230艘。95年補助對象將擴及屏東、台東等縣延繩釣漁船，亦將繼續印製「暫定執法線」示意圖分送漁民使用，並洽請海巡署加強護漁頻度，以維護漁民在該海域作業安全。

(二)調整漁業產業體質

1. 強化漁業資源復育，建構優質漁場

   賡續推動海洋牧場及沿岸漁場改造，94年於澎湖內垵、宜蘭東澳進行海洋牧場建設，並於沿海16處人工魚礁區投放電桿礁4,000座及大型鋼鐵礁45座；95年將結合民間自主性管理機制，將人工漁場規劃成為兼顧海底觀光、船釣、潛水遊憩等優質經營環境，促進沿近海漁業多元發展。為增裕漁業資源，實施種苗放流，94年放流石斑、鯛類、尖吻鱸、烏魚、午仔、青嘴龍占等魚貝苗約1,000萬尾(粒)，預估可增裕漁業資源4,250公噸。為紓緩沿近海漁業漁場壓力，降低漁獲努力強度，減少我國漁船總數及淘汰不適經營之漁船，自80年起，實施自願性減船措施至今，收購漁船2,781艘，14萬船噸，漁筏93艘。

   推動漁業資源保育，取締非法捕魚，除協請海巡署加強執行海上護漁與取締非法捕魚外，另本會與各縣(市)政府共同組成之「聯合取締非法捕魚工作小組」，94年計取締262件；此外，為彰顯我國打擊公海違規流網漁船作業之決心，亦協調海巡署分別於94年4月及8月間派遣「巡護三號」及「巡護二號」至北太平洋海域執行巡護2航次，計167天。

2. 專用漁業權與海域多元利用與競合問題

   沿岸海域除供漁民漁撈作業外，亦可提供國人親水、遊憩等使用，兩者使用發生競合，以致衍生政府推動公共建設時，漁業權人要求補償金問題，造成社會大眾對漁業形象有負面評價。原早期核發為期10年之42件專用漁業權執照，已陸續到期，迄94年底有38件提出重新申請。為建立漁業權公平、合理之審查制度，本會漁業署已訂定「專用漁業權執照審查核發作業要點」，由本會漁業署、內政部、經濟部、交通部、國防部及學者專家共同組成審查小組，依海域利用之權利與義務對等之原則進行審查，目前刻正進行審查中。95年將輔導相關漁業團體提升海域經營管理能力及形成漁場之具體作為，俾利核發專用漁業權執照。

(三)發展核心養殖產業及養殖漁業生產區

　　發展核心養殖產業，選定水產種苗、海鱺及石斑魚為核心發展魚種，推廣繁養殖技術及強化業者經營管理能力。整合養殖場經營規模，規劃設置完成47個養殖漁業生產區，計13,630公頃。94年於雲林縣下崙北區等3處養殖生產區建設海水統籌供應站，改善進排水設施11公里。為提高市場職能，建立多元運銷管道，輔導改善漁貨直銷中心、魚市場產銷環境設施，並導入電腦拍賣，使交易制度更公平透明。

(四)輔導漁港多元利用與分級管理

　　為促進漁業轉型，持續推動漁港多功能建設計畫，以朝休閒、觀光及教育文化等多元發展，提高漁港使用效能。94年已辦理正濱等64處漁港漁業公共設施建設；配合觀光客倍增計畫，針對高雄興達、桃園竹圍、永安、彰化王功、嘉義東石及花蓮等6處漁港，進行浮動碼頭、木棧道及港區環境景觀建設，發展具地方特色之觀光休閒漁業。另為推動民間參與公共建設，94年完成王功漁港港區與將軍漁港魚貨直銷中心之委託經營案。