貳、重要事紀
六月份
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舉辦第二屆「全國優質茶競賽」。
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舉辦「健康台灣，優質農業」活動。
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辦理「台灣木瓜首航日本暨輸日優質農產品發表會」， 陳總統應邀親臨指導並致詞。
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6 月中旬豪雨，造成台灣地區農作物受損，其中雲林縣、嘉義縣（市）、台南縣（市）、屏東縣等縣達現金救助標準及辦理低利貸款，高雄縣青蔥達單項農作物現金救助標準，另高雄縣洋香瓜、蔥及葉菜類等作物及台中縣辦理低利貸款。
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6 月中旬連續豪雨，造成 94 年第1期稻作及高粱倒伏浸水、穗上發芽或稔實不良，本會除依現行規定辦理發芽稻穀收購作業外，並從寬收購品質未達驗收標準之災害稻穀及高粱。
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舉辦「2005 年台北國際食品展」，規劃設置具國際化與專業化之「台灣館」，以「安全、優質」為展示主軸。
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針對彰化縣線西鄉鴨蛋產品檢出戴奧辛含量過高案，本會全面銷毀所有遭污染鴨蛋及鴨隻。
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自 6 月 20 日起至 28 日止受理農民申報收購大蒜；6 月 30 日至 7 月 29 日辦理收購。收購價格每公斤 33.3 元，收購目標 6,000 公噸。
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舉行台瓜（瓜地馬拉）自由貿易協定。
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6 月 10 日起暫停自紐約州輸入禽鳥類及相關產品。
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於雲林、臺中市、彰化縣及臺東縣查獲 4 件違法屠宰豬隻案，沒入銷燬肉品10,980 公斤。
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於防汛期間特別加強轄管林班地內易發生漂流木溪流兩側 50 公尺內或集水區之上游、貴重木地區等之巡視。
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舉辦「2005 治山防災與坡地環境國際研討會」。
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舉辦「台灣地區農田水利會慶祝 94 年水利節暨資績優良人員表揚大會」。
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2005 年北美生物科技產業展（BIO 2005）於 6 月 19 至 22 日在美國費城舉辦，本會以「多樣性的台灣農業生技」為主題與中研院、國科會、衛生署及工業局等機關共同負責我國國家形象館之設計與佈置。
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發布「動物運送管理辦法」。
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發布「漁船輸出許可準則」。
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修訂「漁船建造及漁業證照準則」及「漁船輸出許可準則」
- 發布「農會漁會信用部應報經全國農業金庫同意後辦理或移由該金庫辦理之ㄧ定金額以上授信案件基準」。