1 月

• 訂定發布「漁船捕獲鯊魚魚鰭處理應行遵守及注意事項」。 
• 修正發布「輔導農糧業經營貸款要點」。 
• 發放2011年11月豪雨農業災害救助金10億7,109萬元，協助5萬7,585戶受災農漁民。
• 結束收購2011年2期公糧稻穀，計收購11萬1,969公噸。 
• 於上海大潤發大寧店、楊浦店、春申店以及康橋店等，上架販售國產畜禽加工產品。 
• 以色列同意受理我國育種者赴以國申請植物品種權保護。 
• 於全國各級農漁會建置「農業資訊電子看板」。 
• 舉辦農村再生圖徽發表記者會。 
• 舉辦「第40屆獸醫師節慶祝大會暨全國動物防疫檢疫宣導會」，並表揚資深及傑出貢獻人員。

2 月

• 行政院陳院長?蒞會巡視，本會提出未來農業施政重點工作。 
• 修正公布「農會法」。 
• 修正發布「休閒農場專案輔導實施作業要點」。 
• 修正公布「農田水利會組織通則」；臺北市七星及 瑠公農田水利會之主管機關改為本會。 
• 禁止福建省金門縣偶蹄類動物及其屠體、內臟、生鮮產品輸往臺灣本島及其他離島。 
• 成立進口梨穗聯合採購聯誼會。 
• 舉辦「結合社區加強森林保護工作計畫」啟動儀式。 
• 「灣饗」臺灣農特精品旗艦店於上海日月光中心開幕。

3 月

• 調降專案農貸利息差額補貼基準。 
• 修正發布「輸出入動物產品檢疫簡化作業要點」。 
• 修正發布「農業發展基金貸款作業規範」。 
• 加強家畜及家禽產銷調節措施。 
• 2月霪雨及1-2月連續低溫造成農業受損，公告苗栗縣為辦理農業天然災害低利貸款地區。 
• 許可彰化縣彰化區漁會設立埔心分部。 
• 參加亞非農村發展組織（AARDO）50週年慶祝活動。 
• 舉行101年中樞紀念植樹活動，總統親臨植樹。 
• 舉行「第四屆全國休閒農場童詩童畫」及「第一屆全國休閒農業區兒童作文」競賽頒獎典禮。 
• 舉辦「APEC極端氣候對漁業及養殖漁業衝擊和因應策略研討會」。

4 月

• 修正發布「農會總幹事遴選辦法」。
• 修正發布「農田水利會人事管理規則」。 
• 訂定公告「水車式增氧機節能效率標準及推動節能水車式增氧機補助措施」。 
• 修正公告「申請大目鮪及劍旗魚漁業證明書作業規定」。 
• 訂定公糧濕穀收購作業原則。 
• 參加「大西洋鮪類資源保育委員會（ICCAT）整合監控措施小組（IMM）」會議。 
• 召開「APEC緊急糧食儲備機制工作會議」。 
• 舉行大型土石流防災疏散避難演練，由總統擔任帶隊官。 
• 啟動國產平價豬肉供應平臺。 
• 舉辦「吃得安心」說明會。

5 月

• 修正發布「農會選舉罷免辦法」。
• 公告第一批合格水車式增氧機廠商（型號）。 
• 5月豪雨造成高屏地區受農業災害，啟動災害稻穀收購機制。 
• 解除金門縣口蹄疫管制區之移動管制，恢復為一般場管理。 
• 參加第2屆「APEC糧食安全部長會議」。 
• 參加「大西洋鮪類資源保育委員會（ICCAT）未來工作小組」會議。 
• 參加八田與一紀念園區追思會。 
• 辦理「2012成龍濕地國際環境藝術節」開幕記者會。 
• 舉辦「臺灣牛肉促銷品嚐推廣活動－2012臺灣牛肉嘉年華」啟動記者會。 
• 舉辦「國際生物多樣性日」開幕儀式。 
• 輔導臺灣蘭花產銷發展協會參加英國雀兒喜花展（ Chelsea Flower Show ），並以「龍掌乾坤」為主題設置臺灣館，獲得金牌殊榮。

6 月

• 行政院通過「黃金十年國家願景」計畫，本會所擬「黃金十年樂活農業」，將建構年輕化、有活力、高競爭力且所得穩定之樂活農業。 
• 與行政院原住民族委員會會銜訂定發布「原住民族基於傳統文化及祭儀需要獵捕宰殺利用野生動物管理辦法」。 
• 訂定發布「農田水利會會長選舉罷免辦法」及「農田水利會會務委員選舉罷免辦法」。 
• 訂定發布「行政院農業委員會協助產業創新活動補助及輔導辦法」，另「農業產業技術研究發展補助辦法」同時廢止。 
• 修正發布「農會法施行細則」；完成縣、市合併改制為直轄市後，臺中、臺南及高雄三市之縣農會及市農會更名與掛牌。 
• 修正發布「動物傳染病防治條例」。 
• 修正公告「動物及動物產品輸入檢疫條件」。 
• 修正公告「高病原性家禽流行性感冒檢驗方法」。 
• 6月豪雨及泰利颱風造成農業災害，公告桃園縣、嘉義縣、雲林縣、臺中市、屏東縣及南投縣為辦理農業天然災害低利貸款地區；辦理桃園縣西瓜、香瓜及洋香瓜單項作物現金救助及蔬菜、花卉（苗圃及其他花卉）及塑膠布溫網室整體結構專案補助；辦理新竹縣西瓜、香瓜及洋香瓜單項作物現金救助；辦理臺東縣水稻及高雄市木瓜專案補助，辦理臺中市東勢區等4區甜柿專案補助；辦理嘉義市一期水稻；雲林縣全縣一期水稻、落花生及食用玉米、斗六市等3鄉鎮市蓮霧、東勢鄉等4鄉鎮牧草（青割玉米）、虎尾鎮等3鄉鎮洋香瓜及古坑鄉香蕉；屏東縣全縣苦瓜、胡瓜、木瓜及西瓜、里港等3鄉楊桃、長治等2鄉水平棚架網室塑膠布（網）專案補助。 
• 參與「全國氣候變遷會議」，提出農業部門的因應策略報告。
• 舉行2012年水利節慶祝大會，並表揚績優人員。 
• 與行政院海岸巡防署共同舉辦「世界海洋日」慶祝典禮。 
• 舉辦「田園媽媽味—農粽上市」記者會。 
• 舉行《耕耘臺灣 農業全印象》5部系列紀錄片發表會。 
• 於「2012臺北國際食品展」，設置「臺灣館」，展出農產品。 
• 舉辦「農業產學合作商機媒合交流會」。 
• 舉辦「 2012 海峽兩岸農藥管理暨技術研發成果交流研討會」。

7 月

• 修正發布「老年農民福利津貼申領及核發辦法」。
• 修正發布「農會漁會信用部各項風險控制比率管理辦法」。
• 修正發布「漁船建造許可及漁業證照核發準則」。 
• 訂定公告「中國大陸產櫻桃鮮果實輸入檢疫條件」。 
• 召開「全國農業行政首長座談會」。 
• 舉辦2012年全國漁民節慶祝活動，並表揚模範漁民及對漁業有貢獻人士。
• 辦理「第2屆大專生洄游農村競賽」駐村團隊共識營活動。 
• 「農村市集通」網路平台上線運作。 
• 舉辦「2012臺灣野望國際自然影展」。
• 啟用林務局觸口自然教育中心綠意館。 
• 辦理「農村真好 ! 讚聲有禮」活動。 
• 參與2012臺灣國際生物科技大展，負責設置「農業科技主題館」，並展示本會十大研究團隊近年來具商品化與產業化潛力或已有產業化實績之研發成果。 
• 公告「墨西哥自高病原性家禽流行性感冒非疫區刪除」。

8月

• 修正發布「清除豬瘟暨口蹄疫所需疫苗之種類及其管理辦法」。
• 訂定公告「農會農事小組組長、副組長、會員代表之選舉投票日」。
• 蘇拉颱風造成農業災害，公告臺東縣、宜蘭縣、花蓮縣、南投縣及苗栗縣為辦理農業天然災害低利貸款地區；天秤颱風造成農業災害，公告臺東縣為辦理農業天然災害低利貸款地區。
• 結束101年1期作公糧稻穀收購，共收購31萬3,325公噸。
• 推動「強化屠宰場牛隻人道管理及屠宰衛生檢查具體措施」。
• 函請農漁會訂定相關收費標準及公布於網站。
• 辦理「國產牛肉產地標示」宣導講習會。
• 舉辦「農業生物技術產業化國際趨勢發展論壇」。
• 舉辦「2012年水產精品評選暨頒獎典禮」。
• 公告「新加坡為口蹄疫及狂犬病非疫區，瑞典為馬鼻疽、高病原性家禽流行性感冒及新城病非疫區，波蘭為高病原性家禽流行性感冒非疫區」。

9月

• 修正發布「農會選舉罷免辦法」。
• 公告「乙型受體素（β-agonist）為禁止製造、調劑、輸入、輸出、販賣或陳列之藥品。但不包括作為牛隻使用之含藥物飼料添加物」。
• 總統接見全國農田水利會模範組長及農田水利會會長。
• 辦理臺北市七星、?公二農田水利會第3屆直選會長暨會務委員選舉。
• 召開「第14屆臺荷農業合作會議」。
• 召開「第9屆臺澳農業合作會議」。
• 召開「鰻魚資源合作會議」。
• 舉辦「2012年臺歐盟動物疾病區域化暨進口食品管理研討會」。
• 參加第5屆海峽兩岸農產品檢疫檢驗研討會。
• 我國正式成為「南太平洋區域性漁業管理組織」（SPRFMO）之「委員會會員」。
• 訂9月1日為2012年小花蔓澤蘭防治日。
• 舉行「行政院農業委員會十大研究團隊重大研發實績」表揚典禮。
• 參與「2012臺北國際發明暨技術交易展」，設置「農業館」，展出農業科技研發成果。
• 參加「2012海峽（福州）漁業週暨第7屆海峽（福州）漁業博覽會」。
• 舉辦「2012積極護生方案國際研討會」。
• 舉辦「璀璨四健 精彩六十」四健會60週年慶祝活動。
• 舉辦「八斗子碧砂漁港遊艇碼頭啟用典禮」。
• 舉行「世紀風華—阿里山森林鐵路百年專書」及「臺灣淡水魚類紅皮書」新書發表會。
• 舉辦「2012年APO應用奈米科技提高農業生產力研討會」。
• 訂定公告「中國大陸產梨接穗輸入檢疫條件」。

10月

• 訂定發布「青年從農創業貸款要點」。
• 訂定發布「動力漁船所有人保險獎勵辦法」。
• 修正發布「魷釣漁船及漁業專用漁獲物運搬船赴大陸地區港口卸售漁獲物應行遵守及注意事項」。
• 修正發布「農民經營改善貸款要點」。
• 修正發布「農業產銷班及班員貸款要點」。
• 修正發布「農業發展基金貸款作業規範」。
• 修正發布「農家綜合貸款要點」。
• 公告延長免徵進口玉米5％營業稅半年至2013年4月5日。
• 參加「南方黑鮪保育委員會（CCSBT）第7屆紀律委員會暨第19屆延伸委員會」會議，通過2013年我國漁獲配額為945公噸。
• 臺北市七星、?公農田水利會第3屆直選會長及會務委員當選人宣誓就職。
• 全國農業金庫臺中分行及高雄分行開始營業。
• 與亞太糧肥中心合辦「加強亞太地區農村再生國際研討會」。
• 舉辦「農村婦女巧藝商品上架記者會」。
• 舉辦「第2屆大專生洄游農村競賽」成果發表會暨頒獎典禮。
• 舉辦「農村再生 有你尚讚」活動，表揚具有卓越貢獻的個人與團體。
• 舉辦「2012臺灣國際豬腳節」大型宣導活動。
• 舉辦2012年森林火災陸空聯合防救演練。
• 參與「2012臺北國際旅展」，設置「臺灣休閒農業館」及「農業好伴手館」，行銷休閒農業旅遊及優質農業伴手。
• 訂10月29日至11月4日為「全國農地滅鼠週」。
• 「九九蜂鷹」生態影片勇奪第47屆電視金鐘獎攝影獎。
• 公告「關島為狂犬病非疫區，全球皆為牛瘟非疫區」。

11月

• 臺灣省漁會升格更名為中華民國全國漁會。
• 公告「澳大利亞新南威爾斯州自高病原性家禽流行性感冒非疫區刪除」。
• 辦理「國產牛肉追溯資訊系統」啟動記者會。
• 與WTO在臺合辦「2012年亞太區域SPS（食品安全檢驗與動植物防疫檢疫）協定應用訓練課程研討會」。
• 參加「大西洋鮪類資源保育委員會（ICCAT）第18屆特別會議」。
• 水保局4項工程及林務局1項工程，獲得公共工程金質獎殊榮。
• 啟用羅東林業文化園區「森美館」。
• 舉辦「2012臺灣國際觀賞魚博覽會」。
• 舉辦「生態系統暨生物多樣性經濟倡議（TEEB）研習會」。
• 舉辦2012年「里山倡議精神的實踐」研討會。
• 舉辦2012新社花海系列活動。
• 組團參加「2012上海秋季國際食品展」。
• 舉辦鰲鼓濕地森林園區開園活動。
• 召開2012農業伴手新品發表記者會。
• 與亞太糧肥中心合辦「永續發展亞洲地區柑橘產業—柑橘黃龍病流行病學與病害管理國際研討會」。

12月

• 修正發布「老年農民福利津貼申領及核發辦法」。
• 訂定發布「租用漁船從事水產資源海洋環境調查研究及漁業管理暫行措施」。
• 公告劃定高雄市美濃區美濃休閒農業區、宜蘭縣頭城鎮新港澳休閒農業區、臺中市新社區抽藤坑休閒農業區，並公告修正宜蘭縣冬山鄉梅花湖休閒農業區之範圍。
• 參加「中西太平洋漁業委員會（WCPFC）第9屆年會」。
• 召開「第19屆臺美農產品檢驗檢疫技術工作小組諮商會議」。
• 召開「第4屆臺琉技術研究交流會議」。
• 自中國大陸輸入4批梨接穗，總計1萬380公斤。
• 舉辦2012科技農企業菁創獎頒獎典禮。
• 舉行2012 CAS臺灣優良農產品標章授證典禮。
• 農業兒童網（http://kids.coa.gov.tw）獲頒「2012年臺灣優良兒少網站徵選活動」生活資訊類第1名。
• 辦理「花東花海行‧農遊GO幸福」系列活動。
• 舉辦「2013臺灣農漁會百大精品展」。
• 辦理「2012雞肉飯節」活動。
• 召開「國民美味?食－秋刀魚」記者會。
• 公告「巴西為牛海綿狀腦病發生國家」。
• 訂定發布「農藥管理法第7條第2款所定摻雜其他有效成分含量之限量基準」。