一、6月1日辦理雲林濁幹線百年大圳通水典禮暨健行活動，慶祝1924年開通灌溉水圳濁幹線，讓看天田獲得穩定的灌溉水源，雲林成為臺灣的農業大縣。

二、6月3-4日派員參與「第3次日本鰻及其他鰻科學家會議」，著重討論東亞地區日本鰻資源養護管理與研究現況，並以科學根據為基礎，提供鰻魚國際非正式會議相關資源養護管理建議，作為今後東亞各國合作方向。

三、6月3-7日舉辦「蔬菜種植創新技術研習會」，來自14個亞洲生產力組織（APO）會員國的25名代表，共同研習蔬菜種植領域的智慧農業技術與未來發展，並赴本部桃園區農業改良場、桃城蒔菜農業生產合作社及力青農場，實地觀摩我國農業技術應用。

四、6月4日辦理「電池x農機跨域交流工作坊」，從農機需求端、電池端技術與產品規格盤點表列等面向，進行未來應用發展策略規劃討論，並橋接國產電池業者與有意投入電動化農機業者進行交流，以促成規格與可適用標準溝通，期帶動規模化發展。

五、6月5日日本公告我國產三角柱屬紅龍果，包含紅肉、紫紅肉種及其雜交種等，皆可輸入，其檢疫條件為以飽和蒸氣使蒸熱庫內溫度達48℃以上維持至少136分鐘後，果實中心溫度達46.5℃以上處理30分鐘，以通風方式冷卻，並經臺日雙方檢疫人員共同檢疫合格。首批紅肉紅龍果已於6月24日空運抵達日本並順利通關。

六、6月6-7日派員參與「第17屆鰻魚資源養護與管理國際合作非正式會議」，討論第3次日本鰻及其他鰻科學家會議總結報告，並檢視2023-2024年漁季鰻魚（含鰻苗）之捕撈、養殖和貿易統計數據更新、鰻魚資源保育措施、日本鰻及其他鰻於相關國際組織討論概況，以及建立具法律約束力之國際/區域性管理組織可能性等。

七、6月7日函請全體農漁會信用部確實依聯徵中心規定辦理授信案件「綠色授信」及「永續績效連結授信」等註記報送作業，並要求全面清查現行授信案件補辦理註記，以正確揭露金融統計情形並作為金融資訊交換。

八、6月11日辦理「守護：百步蛇野外護卵孵化記錄發布記者會」，公開發表本部林業保育署臺中分署團隊112年在八仙山國家森林遊樂區完整記錄全球首筆野生百步蛇的生殖生態珍貴資料。

九、6月12-14日派員參加「第12屆臺日漁業科研合作諮商會議暨研討會」，商討鮪魚、秋刀魚及鰻魚經濟魚種資源評估與養護管理，並分享海洋碳匯議題研究成果。

十、6月13日因應0403花蓮地震，更新113年全臺土石流潛勢溪流資料及土石流警戒基準值，新增土石流潛勢溪流4條(花蓮縣秀林鄉)，使全臺土石流潛勢溪流增加為1,736條，分布於17縣(市)、159鄉(鎮、市、區)、690村(里)。

十一、6月14日舉辦「112年度農產電子商務包裝及品牌輔導計畫成果發表會」，展出10家青農創新品牌及其商品，並以電商平臺行銷臺灣在地農產新品牌，帶動區域特色農產品加值發展。

十二、6月14日啟用本部輔導之首座區域型農業塑膠資源循環場域，並舉辦「實地操作觀摩會」，分享案例並引導循環場域觀摩，讓與會者實際瞭解田間回收之農膜經水洗、破碎及乾燥等程序可產出乾淨產品，以及污水淨化回收再利用情形。

十三、6月19日因應西非國家加彭向世界動物衛生組織通報首次發生非洲豬瘟（ASF)，將該國列入過去三年發生非洲豬瘟國家及高風險國家名單。 

十四、6月19-21日於「2024亞太區農業技術展覽暨會議」設置臺灣館，展出農業科技產業化成果，並以整體形象進攻國際農業技術交易市場。本次臺灣館業者陸續與各國買家媒合商洽420場次，並有100家次提出後續合作或採購意願，預估交易金額可達3,000萬元。

十五、6月19、20-21、27及29日陸續舉辦阿里山林鐵全線正式通車前系列暖身活動，包括「《2421 m的迴聲──阿里山林鐵全線紀行》新書發表會台北場」、「祈福列車」、「『山行記憶˙奮起湖—車庫歷史榮光再現』奮起湖車庫開展典禮」，以及「林鐵開箱市」等。

十六、6月20日預告「農會選舉罷免辦法」第11條修正草案，修正第5項基層農會農事小組選舉候選人，得於候選人資格審查確定造具名冊報請主管機關備查之次日起3個工作日內，親持國民身分證向農會申請閱覽所屬選區選舉人名冊，以1次30分鐘為限，以避免農會會員個人資料外洩，維護農會選舉之公平性。

十七、6月20日公告澳大利亞新南威爾斯省自高病原性家禽流行性感冒非疫區刪除，該地區之活禽鳥及其相關產品自公告日起禁止輸臺。

十八、6月21日發布訂定「一百十三年獎勵農業旅遊自由行作業規範」，整合本部電商平台花蓮專案促銷活動及搭配交通部觀光署觀光振興相關措施，訂於7月1日啟動「從心出花2.0」振興專案，推出花蓮振興農粉幣電子票券。

十九、6月21日本部版本之植物診療師法草案提報行政院第3909次院會討論，決議通過；同日函請立法院審議。

二十、6月21日派員赴美參加「2024年臺美漁業雙邊諮商會議」，與美方就國際漁業議題進行年度諮商；並就續簽「臺美漁業及養殖合作瞭解備忘錄」進行意見交換。

二十一、6月24日發布修正「外銷養殖鰻魚生產管理證明核發要點」，明確定義採樣人、販運商、出口商、包裝廠及加工廠向本部漁業署辦理登錄之要件、延長登錄有效期限至5年及修正鰻魚外銷供貨量不得超過實際放養鰻線重量之1,500倍，以強化外銷鰻魚品質，同時依產業實務提升簡政便民。

二十二、6月26日於「2024年台北國際食品展覽會-臺灣館」設置形象館，展示臺灣農產品近年在國際市場檢疫諮商及拓展市場的成果；另見證日商MMY株式會社（唐吉軻德日本供應商）與臺灣優良農產品發展協會共同簽署擴大通路販售合作備忘錄。