(一)養豬產業升級與結構調整
● 提升豬隻育成率
　　為推廣養豬農民使用新式生產系統管理模式，委請農業科技研究院編製手冊， 至2023年底輔導養豬場2,008場次，推行批次生產及目標管理，落實正確生產紀錄，並導入適合新式設施（備）提升生產效率，受輔導場之每頭母豬年產肉豬上市頭數成長率達4％。
　　本部畜產試驗所持續輔導養豬場提升育成率，2023年輔導74戶養豬場，進行182場次訪視輔導，所輔導養豬場之豬隻育成率平均為84.87％，每頭母豬平均年產離乳仔豬頭數（PSY）與每頭母豬平均年上市肉豬頭數（MSY）分別為19.9頭與16.3頭。
　　另辦理2場次教育訓練及出版提升豬隻育成率輔導成果手冊，藉由同業間之經營理念與生產技術經驗分享，進而移植到經營養豬場中實際運用，提升養豬場育成率。
● 養豬產業轉型升級
　　推動養豬產業全面轉型升級計畫，透過源頭調節及總量管理等方式，2023年維持毛豬拍賣價格在合理區間內，全年平均毛豬拍賣價格89.61元／公斤，並將全國豬隻頭數達1,240萬9,000頭全數納保。另持續拓銷我國豬肉外銷市場，活豬、豬肉及相關產品出口量為2,899公噸，產值達7億2,000萬元；此外，持續推動屠宰場現代化及肉品冷鏈升級，豬隻屠宰場完成HACCP驗證者達11家。輔導養豬場現代化轉型升級，導入現代化省工設備達1,473場次，累計輔導2,039場（占全國豬場之35.13％），成效良好。
● 提升國產生鮮豬肉品質與安全
　　為保障消費者權益，持續強化國產毛豬標示追溯碼以溯源至來源牧場，達到區隔國產與進口冷凍肉品，累計至2023年底國產生鮮豬肉可追溯率達92％之目標值。
　　為因應國內消費市場對肉品衛生安全要求日趨嚴格，且國際間推動屠宰場HACCP普及化趨勢，本部自2020年政策性輔導推動屠宰場現代化及肉品冷鏈升級，並修正屠宰作業準則及訂定「屠宰場肉品衛生安全管制系統實施及驗證作業要點」以來，以輔導、訓練、驗證為配套主軸，提供包括驗證申請範本、派員現場輔導驗證、辦理管制人員教育及內臟清洗等訓練班等措施，輔導全國畜禽屠宰場，經由審查委員書面審查、實地查驗、最終審查會審核通過，再由本部核實發給中、英文驗證證明書，至2023年底已完成25家屠宰場HACCP驗證，成功引導屠宰場建立現代化管理系統。
(二)家禽產業升級與結構調整
　　為確保國內各通路雞蛋需求、穩定雞蛋產銷秩序與價格，2023年辦理多項因應措施精進雞蛋產銷，包括：於本部官網建立雞蛋產銷資訊平臺，每週更新提供蛋雞生產資訊及雞蛋供應量等資料，供業者作為產銷調節參考；定期召開產銷預供調配會議，進行資訊研判，掌握雞蛋生產與銷售狀況；為增加雛雞供應量及加速更新母雞群，進口種雞數自前一年26萬隻提高至33萬隻，提升產蛋效率。
　　另為應對全球極端氣候影響，加以國際禽流感疫情嚴峻，造成養禽損失，且國內養禽場設備老舊，有生物安全防疫漏洞，往往需投入高成本人力負擔，產業較不具競爭力。為從根本提升禽場生物安全及抗逆境能力，提升經營效率，加速產業升級，規劃輔導禽舍改建升級為非開放式或密閉水簾禽舍、導入自動化設備。優先協助中小規模傳統養禽場投入改建，並提高補助款提升其意願，同時籌組專家技術團隊，協助養禽場現場技術輔導工作。2023年輔導禽舍改建為非開放式或密閉水簾禽舍計73場。
(三)草食產業升級與結構調整
　　為因應國際貿易自由化競爭，除重視防禦性措施固本外，亦持續推動草食家畜產業創新加值與結構調整，積極推動新產業價值鏈，發展高能效生產模式，穩定國產品供應量，另佈建安全生產及認驗證體系，形塑優質畜產品形象，以符產業發展趨勢，維持牛羊拍賣價格在合理區間內，2023年平均牛羊拍賣價格肉牛120.75元／公斤、肉羊381.84元／公斤；另持續推動輔導牛羊產業冷鏈設施設備升級現代化計畫，辦理完成：1.優化臺南市肉品市場牛隻屠宰線工程1式，2.乳牛場低溫儲乳槽56臺，3.國產牛、羊肉屠體溫控車輛及低溫儲乳、溫控等設施共34臺。
(四)推動畜禽糞尿資源化處理
　　本部與環境部及經濟部產業發展署等跨部會共同推動資源化政策，如加強宣導業者減少畜舍之沖洗次數、推動畜牧場設置節水、廢水循環再利用等設備及糞尿水資源化循環再利用等措施，共同達成資源化處理之政策目標，迄2023年底止，全國合計推動糞尿水施灌計3,552案，每年許可施灌量逾1,145萬600公噸，施灌面積達5,045公頃，估計相當於減少施用544萬7,000包台肥5號複合肥料。另外擴大推動養豬場植種污泥應用於工業端廢水如石化、光電、染整業等，迄2023年底累計達5萬6,000公噸，達到農工雙贏的目標。
　　畜禽糞尿水處理過程中厭氧發酵階段所產生之沼氣，也是極具潛力之資源，本部自2017年起擴大推動養豬場沼氣再利用（發電），迄2023年底止累計投入豬隻總頭數達278萬4,879頭，可減少7萬5,000公噸溫室氣體排放，相當於26萬5,000輛機車年碳排量以及195座大安森林公園碳吸納量。
　　本部畜產試驗所透過分布於全國8處之畜牧污染防治輔導團，就近協助地方政府輔導在地畜牧場，針對畜舍改建、飼養管理與飼料營養及畜牧場污染防治等專項進行客製化輔導，協助地方政府農業局及環保局辦理沼液沼渣農地肥分使用計畫審查及現地輔導，共計輔導530場次；亦配合地方政府或產業團體辦理相關說明會、講習班及現場觀摩會等共18場次。舉辦「2023年養豬場節水減廢及資源化利用輔導團研習會」，透過研習課程精進輔導人員專業知識及輔導技能；另本部畜產試驗所配合推動畜牧糞尿水資源化利用政策，近10年來持續監測施灌養牛糞尿水於盤固草地之土壤及地下水，結果顯示對施灌土壤之電導度、總銅、總鋅等均遠低於停灌標準規定；地下水下游監測井之氨氮（NO3-N）監測值，顯示皆無明顯變化。