現行「農業綜合調整方案」將於八十六年度(八十六年六月)實施屆期，為配合跨世紀國家建設計畫構想，本會已草擬完成「跨世紀農業建設方案」，預定十月中報行政院核定後，於八十七年度開始實施，為期四年。

　　本計畫將接續「稻田轉作計畫」，其目的在確保國內糧食安全、符合世界貿易規範，並加強農田生態保育，全案已於八月二十日報院核定中。

　　農會法、漁會法修正草案，已會同內政部研擬完成，修正重點包括：主管機關移隸農委會、規範選聘任人員產生方式與任期、加強信用部管理。農田水利會組織通則修正草案預定十月底報院。

　　為安定農業經營，將規劃十七種重要農畜產品之產銷預警系統，組成產銷預警小組，掌握產銷動態，必要時辦理市場調節及促銷，以達先期預警、調節供需之目的。

　　七月底已經完成「農業天然災害嚴重程度認定標準」之修訂使災區認定更具彈性，並將訂定救助作業程序及簡化救助申請手續，使受災農漁民於一個月內獲得救助。

　　增設農藥生化檢驗站十處，加強農藥殘留檢測，建立農藥檢驗定期公告制度。完成死廢禽畜之處理流程與管理規劃，並針對高屏溪流域之畜牧污染設置十處監測站，加強畜牧污染監測、處理與檢查，以保護消費者安全及維護生態環境。

　　將於十一月底前規劃完成尚未檢定之區外保安林檢訂計畫，以防止保安林濫墾，並檢討已完成檢定清查之保安林，認已無存在必要者，提出解除申報。

　　輔導成立「中華民國水產種苗協會」，結合政府及民間力量，帶動種苗事業發展，於本 (八十五) 年年底前完成五處種苗外銷包裝場及設置菲律賓、印尼之轉運站。

　　十月底前完成魚塭休養可行性之規劃研究，十一月完成海面箱網養殖示範區規劃，輔導養殖往海中發展，配合南向政策引導養殖漁業進行海外投資；國內養殖生產區則於本年度完成四十區之整建，以利水土資源之合理使用。

　　研擬國內豬瘟撲滅計畫，並於七月報院，預計至八十八年底布台灣為非豬瘟疫區；另將研擬完成日本實施進口豬肉特別防衛條款（ＳＧ）之因應對策，以穩定毛豬產銷。　　　　　　　　　　　

　　本項修正草案已經行政院審議通過，敬請　大院惠於本 (八十五) 年底前完成立法程序，藉以放寬法令限制，活潑農地資源利用。

　　將分別就南向農業合作、國際漁業合作及與先進國家之農業合作等項目完成規劃，據以加速推動。