中華民國政府年度施政方針係由行政院審度國家建設需要，通盤衡量國家可用資源而訂定。行政院農業委員會依據行政院之施政方針，訂定農業施政計畫。八十六年度除執行完成「農業綜合調整方案」之外，為因應總體環境變遷，促進農業發展，並已研擬完成「跨世紀農業建設方案」，將自八十七年度起實施四年，持續發展現代化農業

，建設富麗農漁村，增進農漁民福祉。

一、施政方針

　　86年度農業建設之施政方針包括以下7項：　　　　　　　　　　　　　　　

(一)執行完成六年「農業綜合調整方案」，配合加入世界貿易組織之進程，調整產業因應對策。

(二)調整稻米生產目標，推動水旱田利用調整計畫；加強農地利用規劃及農地釋出，輔導地區性農特產品產銷，提昇產品競爭力。

(三)規劃經營森林資源，加強國土保安及野生動植物保育，促進生態平衡。

(四)落實責任制漁業，調整沿近海漁業生產結構，發展栽培漁業，促進養殖漁業與環境之和諧，防止超抽地下水。

(五)強化動植物防疫、檢疫體系，落實污染防治工作；輔導畜牧業者合作經營，降低產銷成本。

(六)培育核心專業農民，改善農漁村生活環境，增進農漁民福祉。

(七)加強農業科技研發，推動南向農業合作計畫。

二、施政計畫

　　本會86年度施政計畫之要點及重大施政目標如下：

(一)研修訂農業法規，強化農業施政之法令依據；執行完成「農業綜合調整方案」，並研訂新方案以為接續；配合國家整體政策，推動兩岸農業交流及南向農業合作計畫。

(二)加強農地資源之利用規劃，推動農地釋出方案，健全農地轉用制度；辦理農漁村社區建設計畫，提高農漁民生活品質；發展休閒農業，促進農村與都市均衡發展。

(三)調整農業生產結構，建立集團經營及水旱田輪作制度；加強農業科技研發與推廣，推動農漁牧產業自動化，促進農業企業化經營，降低農業產銷成本，提昇競爭力；發展加工食品，提高農產品附加價值。

(四)改善農產運銷體系，建立國產農產品優良品牌形象，拓展國內外市場；調整農產品進口管理措施，辦理農產品受進口損害救助。

(五)繼續推動農田水利建設，提高農業水資源利用效率；實施森林資源多目標利用規劃，加強山坡地保育利用，落實水土保持及治山防洪，保育野生動植物，維護自然文化景觀。

(六)積極參與國際漁業組織活動，加強國際漁業合作，落實責任制漁業；調整沿近海漁業生產結構，發展栽培漁業，促進養殖漁業與環境之和諧；推動「第三期台灣地區漁港建設方案」，改善漁業生產環境。

(七)加強農業污染防治，輔導畜牧場廢水、廢棄物處理與利用，強化農藥、飼料、動物用藥管理與動植物疾病防治、防疫、檢疫措施以及獸醫服務體系，健全國內外疫情情報系統，確保產品衛生安全。

(八)強化農民團體服務功能，加強專案農漁業貸款業務，培育核心農漁民；辦理農業天然災害救助，安定農民生活；發放老農福利津貼，增進農民福祉。

(九)健全全國性農情查報體系，加強農業統計調查及主要農畜產品生產預測；策劃推行全國農業資訊系統，增強農業資訊服務功能。