中華民國政府年度施政方針係由行政院審度國家建設需要，通盤衡量國家可用資源而訂定，本會則依據所頒施政方針，訂定農業施政計畫。
　　因應總體環境變遷，本會自87年度起推動為期4年的「跨世紀農業建設方案」，將積極發展現代化農業，建設富麗農漁村，增進農漁民福祉，以促進本土農業之發展。

　　中華民國政府年度施政方針係由行政院審度國家建設需要，通盤衡 量國家可用資源而訂定。87年度有關農業建設之施政方針包括以下6項：

(一)推動跨世紀農業建設方案，調整產業結構，確保糧食安全；加 強農地利用規劃，協調推動農地釋出；整合農產品產銷資訊與調節工作 ，建立效率、安定之產銷體系。

(二)加強動植物檢疫、防疫、用藥安全以及污染防治，推動豬瘟及 口蹄疫撲滅方案，確保產品衛生安全；提高國產農產品品牌形象，加強 辦理教育宣導。

(三)落實責任制漁業，推展國際漁業合作；調整沿近海漁業生產結 構，發展栽培漁業；推動建立亞太水產種苗中心；強化漁業公共設施與 漁民海難救助。

(四)規劃經營森林資源，推動區外保安林檢訂管理；加強野生動植 物保育及水土保持，維護生態平衡與國土保安林檢訂管理；加強野生動植物保育及水土保持，維護生態平衡與國土保安。

(五)強化農漁民產銷經營能力，輔導農漁民組織穩健經營，推動整體性農漁村建設，建立富裕、自然之農漁村生活環境，發揚農漁村傳統文化，增進農漁民福祉。

(六)加強農業科技研發，加強兩岸農業交流合作，推動南向農業合作計畫及與先進國家之國際農業合作。

　　本會依據行政院87年度施政方針，衡酌整體經濟與農業發展情勢，以「跨世紀農業建設方案」為主軸，配合核定預算之額度，編訂87年度施政計畫，其要點及重大施政目標如下：

(一)建立糧食安全體系，調整水旱田利用，擴大良質米產銷；落實責任制漁業，發展栽培漁業及海上箱網養殖，推動建立亞太水產種苗中心；輔導畜牧產業合理化經營，推動契約產銷及統合經營制度。

(二)設置產銷班及農漁民團體穩健經營，加強產銷組織之企業經營理念；配合產業發展需要，以研究群制度積極推動重點產業、生物技術及自動化科技，增進產銷效率，提昇產業競爭力。

(三)加強動植物檢疫、防疫、用藥安全及污染防治，推動豬瘟及口蹄疫撲滅方案；強化產品衛生安全檢驗與公告制度，提高國產品優良品質形象。

(四)健全全國性農情查報系統，加強農業統計調查及主要農畜產品生產預測，建立產銷預警制度，策劃推行全國農業資訊系統，增強農業資訊服務功能；辦理農業天然災害救助、漁民海難救助及農產品受進口損害救助等，創造安定的農業經營環境。

(五)推動兼顧人文與自然之農漁村建設，發揚農漁村產業文化，加強農漁業公共建設，發展休閒農漁業，並發放老農福利津貼，提昇農漁民福祉及生活品質。

(六)推動森林生態系經營，推行全民造林運動，落實水土保持，加強治山防洪與集水區整體規劃治理，保育野生動植物，維護自然生態。

(七)加強規劃農地利用，推動農地釋出方案，提高農地利用效率；推廣省水灌溉、養殖，適度調配農業用水，促使水資源有效利用。

(八)積極參與國際組織，推動互惠互利的國際農業合作及兩岸農業交流。

(九)因應情勢變遷，調整農業資材管理及農產品進口管理措施，並研修訂農業法規，強化農業施政之法令依據。