(一)漁業資源調查評估及管理

1. 臺灣東部鮪魚資源調查與研究
   調查海區分成二部份，第一部份為成功大武外海離岸約100浬之水域，每季調查乙次，除延繩釣漁獲試驗外，亦作斷面之水溫、鹽度、營養鹽之量測。鮪延繩釣海農試驗船共投放4320?齱A黃鰭鮪平均釣獲率為3.935尾/千?齱A體長分布範圍為105~152㎝，大目鮪平均釣獲率為3.241 尾/千?齱A體長分布範圍為77~113㎝。第二部份為台灣200浬外之菲律賓海水域，有二條固定之斷面調查。除投放CTD外,亦作延繩釣漁獲試驗。劍旗魚之CPUE為5.2尾/千?齱A黃鰭鮪為1.1 尾/千?齱C標本船之統計，1996年及1997年黑鮪較往年有較多量之漁獲，漁場亦較往年接近台灣，1996年春夏鬼頭魚刀未游至台灣東部，而直接進入巴士海峽。1996年12月及1997年元月，對台東縣成功及蘇澳鎮南方澳魚市場進行鮪類體長、體重測定，及漁獲統計資料蒐集。成功魚市場計測量鮪魚1192尾；而南方澳魚市場分別測量了1235尾。
2. 沿岸漁業鯡形魚類資源減產原因之探討
   以臺灣漁業年報43年來的漁獲統計資料，進行時序列分析結果，發現鯡形魚類仔稚魚的生產量逐年在增加，但是成魚漁獲量卻逐年減少。兩者的漁獲量之變化週期大約為6.7年。成魚的漁獲量與當年及往後的第13年的仔稚魚漁獲量彼此為正相關。成魚的豐漁年大約持續2年左右，第6年後進入淡漁年；而仔稚魚的豐漁年大約持續1年，4年後進入淡漁年。整體而言，臺灣鯡形魚類漁獲量的長期變動，與全球氣候變遷、污染以及漁業轉型等有關。
3. 龜山島週邊水域洄游性魚類資源變動特性之研究
   宜蘭灣龜山島週邊海域其主要漁獲魚種包括白帶、鯖?B、紅目鰱、小卷及鰹類等，為探討各主要資源之變動特性，本研究以聲探評估法與漁獲試驗估測海域生物資源量。經由漁獲試驗配合聲探計測得到硬尾之平均體長，且經由漁獲量與聲探計測所獲之生物量之迴歸分析，發現此二者具有相當之一致性，故以聲探系統評估本海域硬尾之生物資源量是可行的。未開發的蝦類資源，其組成以合質蝦（Systellaspis pellucida）、中型毛蝦（Acetes intermedius）及晶瑩櫻蝦（Sergestes lucens）為主；本資源具有日週垂直移動之特性，日間分佈於深度200～250m，至黃昏時則上升至表層。蝦類資源之分佈與海底地形上之關係則主要分佈在海底深度超過200m以上之海域，以聲探計測所得之聲探數理豐度及IKMT採樣所得之生物採樣豐度之比對發現，以聲探系統評估此項資源之可行性相當高。
4. 東港外海燈籠魚漁場與櫻蝦漁場之關係
   東港附近常見的5種燈籠魚是七星魚Benthosema pterotum、纖眶燈魚Diaphus umbroculus、亮胸眶燈魚Diaphus garmani、相模眶燈魚Diaphus sagamiensis及短鰭新燈籠魚Neoscopelus microchir。而常見櫻蝦科蝦類為 Sergia lucens（漁民俗稱花殼仔）、Sergia talismani 及赤尾星Acetes erythraeus。燈籠魚和櫻蝦經常被一起捕獲，在食物鏈中兩者為捕食者與被捕食者的關係。漁場有以下共同的特性：(1)都有一個海灣。(2)其主要漁場之等深線均在400公尺以淺。(3)該海域皆有河川水注入其中。(4)漁場之底質多以泥底、細砂底為主。(5)漁場內之海底地形呈不規則劇烈變化。
5. 衛星遙測系統於建立漁海況預測模式應用之研究
   澎湖附近海域於1990-1993年衛星影像經過處理後，發現在澎湖本島至臺灣淺堆間、大陸福建沿岸海域及本島北淺海域，各存在一冷渦，前兩者涵蓋範圍較大，後者較小。棒受網標本船1990-1993 年漁況資料，配合由日別之帶狀冷渦及北淺冷渦數化之面積、最冷中心溫度、梯度之計算，發現尖仔鎖管CPUE與帶狀冷渦冷水團表層尺度指數(CESSI)間為高度正相關(r=0.8)，與北淺冷渦CESSI也有正相關(r=0.7)，而Loligo 類鎖管與帶狀冷渦 CESSI 間則無明顯關係。
6. 聲光遙測應用於鮆科稚魚漁場形成、加入及管理之研究
   分別分析漁獲量資料、漁獲標本、衛星影像表水溫資料及地面天氣圖，以解析臺灣東北部宜蘭頭城沿海鮆科稚魚之資源變動及加入機制，並與臺灣西南部屏東枋寮沿海鮆科稚魚之加入機制作一比較。所得結果為：(1)由大尺度之水溫標準偏差及宜蘭灣鮆科稚魚春漁期之CPUE可顯示出，臺灣東北部及北部海域，前一月之水溫變動對當月鮆科稚魚之資源變動有顯著的影響。(2)宜蘭灣春漁期之鮆科稚魚為日本鮆，而從衛星表水溫影像圖可發現，宜蘭灣內之鮆科稚魚係由東海南部之冷水所帶入，其適水溫約為22～23℃間。(3)漁期初期漁獲體長分布範圍較廣，約16～35mm，且為整個漁期中之漁獲最高峰，但漁場開放經過一段時間後，漁獲體長甚少超過25mm，且漁獲量驟減。(4)臺灣北部海面鋒面形成後，隨著鋒面向臺灣陸地南移，鮆科稚魚隨之加入至宜蘭灣，同時鋒面持續南移通過臺灣北部陸地後，鮆科稚魚即在漁場內滯留成長，但當鋒面消散，高壓中心位於東海及臺灣北部海面時，則會有較高的漁獲。(5)由衛星表水溫圖與魚體長分布及魚種組成之結果顯示出，當枋寮沿海為北方冷水侵入時，其魚種組成及加入群皆為日本鮆，但為南方暖水侵入時，則有少量的銀帶鰶進入漁場，而宜蘭頭城沿海主要是受東海南部冷水侵入所影響，因此魚種組成皆為日本鮆。
7. 台灣沿近海域漁海況多媒體資料庫之建立
   臺灣沿近海域漁海況多媒體資料庫，是建置於由本會補助經費所架設的網路伺服器(位址：http://f408a.fd.ntou.edu.tw)中。本資料庫共分為5大項，包括定置漁業、人工魚礁及保護礁、箱網養殖、保育區及漁業權。資料內容，除了有漁政單位以往資助學術單位之研究成果報告、相關文獻與圖片外，更有由聲、光、影像、動畫結合而成的多媒體資料。本資料庫之建立有助於漁業行政、教學研究、相關企業、漁民等人士使用。
8. 西北部海域漁業資源資料庫之建立
   針對西北部海域進行調查與整理。調查方式主要為文獻整理、漁民問卷及實地採樣調查。資料庫系統軟體為 Informix 於 Sparc 20 工作站上操作與管理，操作介面以 Microsoft 公司之 Access撰寫，並經由中介軟體連結個人電腦與工作站。目前之西北部海域資料庫已收錄209種魚，共1萬6,800餘筆資料。此資料庫具檔案登錄、整理、查詢、列印諸功能，並可經由 GRASS 地理資訊系統繪出各種魚類在海區之分佈圖。臺灣週邊海域漁業資源資料庫經六年來的資料收集、彙整，目前已建立22萬1千餘筆資料，全部160個漁區收錄之魚種共143科393屬843種。
9. 臺灣沿岸海域定置漁場環境與漁具規模資料庫之建立與應用
   目前已完成台灣沿岸定置漁業資料庫全球資訊網之設計，內容包含全省定置漁業業者及漁場基礎資料，中、外文相關報告及其摘要，與部份漁場流況、等深線、現場具代表性之照片及定置網相關業者資料。未來希望能繼續建構相關資料，俾擴大本網路系統之查詢功能。
10. 人工浮魚礁之設置
    藉由人工浮魚礁之設置，吸引洄游魚類聚集形成食物鏈，從而創造新的漁場，以開發本省沿近海新的漁業資源，開創漁業新機。首次進行本省東北部沿近海域，適合投放人工浮魚礁之地點調查規劃與投放，期能使我國沿近海漁業，能由嚴重不景氣的狀態逐漸地復甦。人工浮魚礁預定投放於台灣東北部龜山島附近海域之水深400公尺處，各項海況之條件分別為風速60m/s，表層流速2.5m/s、波高12.5m、波浪週期14sec。根據上述各項條件，設計出人工浮魚礁，其主要構造包括浮體、礁體、繫纜索以及錨物等4大部分。使用省水試所海鴻號試驗船於民國85年12月20日、86年3月14日、86年5月26日分別進行海洋環境（流向、流速、透明度、各水層水溫、鹽度、營養鹽(磷酸鹽、矽酸鹽、氨鹽及硝酸鹽)、DO、pH）之測定。
11. 漁業公害防治調查及研究
    (1)本年度臺灣海域水質Cd、Cu與Zn之整體不合格率分別為8.8%、1.1%及1.5%，而其他重金屬均符合標準。
    (2)台中縣、彰化縣、嘉義縣至台南縣及屏東沿海有鎘污染之現象；而河川出海口有鎘污染現象的有新竹頭前溪，苗栗的中港溪，台中的大安溪、大肚溪，彰化的舊濁水溪，嘉義的朴子溪、龍宮溪，台南的八掌溪、急水溪及屏東的高屏溪、東港溪；東石港、八掌溪口、大鵬灣(二)在85年10、11、12月鋅污染有突增現象，而嘉義的朴子溪及台南的八掌溪出海口有鋅污染現象，推測應有污染源由此排入；嘉義縣至台南縣沿海銅有偏高現象，而嘉義的朴子溪、台南的八掌溪及鹿耳門溪有銅污染的現象，推測應有污染源由此排入。
    (3)除雲林、嘉義及屏東3縣市外之各縣均有BOD污染現象。86年臺灣沿岸海域均有礦物性油脂污染現象，推測可能與多次漏油事件有關。
    (4)西南沿海各縣市牡蠣養殖區牡蠣體銅含量呈明顯季節性變化，且均顯現冬季高、夏季低之現象。
    (5)部分地區如新竹香山、彰化伸港與福寶、雲林三條崙、台南安平等地區，牡蠣體銅含量較上年度有增加趨勢；另彰化王功86年3月、5月份之吳郭魚及新竹香山86年5月採樣之牡蠣體內檢測出有汞污染，應重點式加強後續追蹤與污染整治。

(二)栽培漁業

1. 開發外海箱網養殖技術

   (1)複式軟式箱網網具設計與繫網用圓柱浮體研究：改良澎湖地區單式軟式箱網結構，利用塑膠PE繩替代尼龍PV繩，可減少附著生物、降低製作成本，以八角型替代四方型網體，在水中可保持良好網型。

   (2)箱網養殖區水質監測：針對台灣省小琉球箱網養殖區進行水質環境監測，包括溫鹽、pH值、溶氧量、懸浮固體量、氨氮、磷酸鹽、矽酸鹽、化學需氧量（COD）、溶解性有機態碳（DOC）等項目，顯示本區域適合養殖溫水性魚類，pH值8.07-8.37符合環保署甲類海域水質，化學營養鹽中之氨氮量符合水產用水基準，但懸浮固體量0.1-4.9mg/l超過水產環境水質2ppm以下；利用海域水質及底棲動物相的改變，可監測箱網養殖對環境的影響。

   (3)箱網附著生物形成機制與防治：箱網附著生物附著過程為初期先有類似細菌性黏膜（diatom slime）附著，接著為紅藻、綠藻、水螅虫、苔蘚蟲、麥桿虫、端腳類依序附著。藻類主要發生於網繩邊緣近光處；水螅虫則在網目隙縫及細菌性黏膜纏繞。有機物Tributyltin（TBT）對不同網繩的毒性釋放速率及防污效果。

2. 種魚之培育研究

   (1)紅甘魚種魚之池中培育：池中培育紅甘?B種魚可替代逐年漸減的野生種。在養殖池中設置遮陽網、適度的換水及混養濾食性二枚貝，且控制微藻量與混濁度，保持水質清澈，可培育紅甘魚種魚；目前已培育二齡魚，但生殖腺仍未明顯發育。

   (2)石斑魚種苗之培育：石斑魚大量受精卵之繁殖技術已建立，但育苗的成功率偏低，尤其在孵化及育苗期間的管理。完成孵化變態期及育苗過程中對氨的急性毒、各發育時期殘食行為因子的探討，並藉由麻醉劑的應用，可提高石斑魚苗之育成率。

3. 幼魚培育與中間育成

   (1)斑蟳幼苗之育成：幼蟳之培育以飼育溫度27℃、鹽度30ppt最佳，鹽度過高或太低將使變態延緩；飼育餌料以輪蟲及豐年蝦混合投餵較佳，至變態活存率可達87％；最佳的蟳苗中間育成條件為每平方米水域放養15隻、底質粗珊瑚礁砂底、具塑膠管及石蓴等掩蓋物，並保持35ppt 30℃的水域成長最佳。

   (2)斑節蝦中間育成：利用澎湖低潮帶潮池內，設置面積約1500平方米之中間育成場，以P25（平均體長19.4mm）1,500,000尾經30天育成，體長可達29.7-32.7mm，活存率為35.3-41.4％；資料顯示增大面積、降低密度，可增加中間育成時育成蝦之活存率。

4. 魚類放流與追蹤調查

   (1)種鰻人工催熟及標識放流：利用4年齡人工培育之種鰻1500kg（約4250尾），經海水馴化後，選取體型碩大、肥滿度高的種鰻900尾實施人工合成性腺激素注射，生殖腺的發育以1-2月最佳，推估種鰻放流季節以冬季較理想。

   (2)標識放流黃錫鯛之追蹤調查：為究明人工培育的黃錫鯛放流後的影響範圍，分析1995及1996年放流魚之分布與移動資料。利用台南分所繁殖體長30mm及85mm的兩批種苗，經225天育成平均體長為106.7mm及193.4mm，育成率63.7％及92.7％；放流地點為基隆大武崙附近海域，至今回收率為1.43％，再捕地點包括大武崙、萬里、外木山、龜吼、野柳、和平島、金山、跳石等地，91％放流魚於離放流地6km內漁獲；最大移動距離11.5km，最長再捕日166天。以24方位法分析顯示放流魚以沿岸移動為主。

(三)水族繁養殖及魚病防治

1. 黃臘?B之成長隨飼料中蛋白質含量之增加而增加，在蛋白質含量達48%後，魚體成長趨於穩定。其達到最佳成長之飼料蛋白質需求量約為54.2%。飼料中礦物質含量高者對魚體之成長較含量低者為佳。
2. 草蝦弧菌對於水產抗菌劑 Oxytetracycline 之抗藥性濃度為0.2mg/ml；點帶石斑對flumequine藥劑之排除半衰期為 7 小時，其停藥期為 16 天。
3. 鰻魚庖疹病毒水平傳播時為高密度養殖狀態且經魚體接觸始能造成感染，常用消毒劑-酒精與過氯酸鈉對其有消毒力。又歐洲鰻養殖期間主要病害為指環蟲、車輪蟲及淡水白點蟲。
4. 澎湖竹灣箱網養殖海域最明顯的病原為貝尼登單殖吸蟲，為害季節自4月至翌年1月，夏季較為明顯。感染魚種有紅甘?B、嘉臘魚、黃花魚、金目鱸、海鱺及赤鰭笛鯛等。
5. 美洲鰻幼鰻飼料中，脂質之適當含量為9～10%(蛋白質/能量比為100mg/kcal)，油脂添加量過多則其成長效果反而有下降之趨勢，又對必需脂肪酸之需求，以18:2n-6較為重要，需求量為1%。
6. 養殖池水質處理劑BKC在含有底泥之池水中，其殘留時間較不含底泥之池水中長；臭氧在海水中之殺菌力僅在飽和之情況才具殺菌效果。

(四)漁業工程技術開發研究

1. 漁船冷凍設備防爆安全設施之研究
   針對冷凍設備安全系統加以診斷，建立1套防爆安全設施提供漁民參考，以減少漁船因冷凍設備爆炸引發火燒船難事故。
2. 漁船於波浪中航行安全性能之研究
   探討漁船於行進中受波浪影響之情況，針對船速、正向波浪橫向波浪，共搖現象所造成之影響建立軟體程序，提供設計參考，以減少漁船翻覆之海難事件。
3. IMO操縱性能之修正條文對漁船相關設計之研究
   配合國際海事組織(IMO) 之安全公約中操縱性能部分之修正條文，加以研究，以提供做為新船形設計之參考，以及改進現有漁船操縱性能，以提高漁船之操航安全。
4. 我國中小型漁船因應亞洲地區45公尺公下漁船國際公約之研究
   建立我國45公尺(約450總噸)以下漁船建造設備之標準化， 以符合國際公約之要求。
5. 我國漁船柴油機與汽油機耗油之現況調查與評估
   實際地調查漁船使用之柴油或汽油主機馬力及耗油之實況， 並予以評估，據以擬定適當之管理措施，以降低漁業營運成本，增加漁民收益。
6. 瘋狗浪引起漁港災害防治對策研究
   針對瘋狗浪的成因進行研析，並預估瘋狗浪發生的時機及研擬有關之防治對策。
7. 漁港附近海岸海濱流系統研究
   建立漁港附近波流作用下港池水面波動模擬與沿海地形的漂沙行為模擬之海濱流系統數值模擬程式，並建立一套港灣佈置與地形的輸入系統，以供漁港規劃建設之參考。
8. 漁港飛沙防治研究
   利用模型試驗與現場觀測探討分析研究台灣西海岸地區各漁港所佈設之各式防風構造物對於減風與飛沙防治之特性與功效， 以及防風設施的佈置，並尋找最佳之佈設方案。
9. 大武漁港漂沙防治研究
   針對大武漁港各期工程施作造成之地形變化與先前規劃預期之差異性作整體檢討，期提出具體改善建議供施工單位參考。
10. 漁船漁獲設施衛生品質規範研究
    研訂適合輸往日本及歐聯地區，漁船上確保水產食品衛生之作業規範。

(一)草食動物

1. 建立國產芻料生產與利用管理模式，經由品種比較及選拔，以狼尾草台畜草二號產量最高，比原有狼尾草增加50公噸以上，比盤固草高出150公噸以上，收穫時亦較不受天候之影響，最佳收穫在6070天或株高150公分左右或乾物質達17％以上時，調製青貯料以香腸式青貯方式最佳，損失僅1-2％，品質評分點70分以上，適口性佳。
2. 以序列式降溫法改善畜舍環境溫度之試驗結果顯示，乳牛於涼前涼後之直腸溫度相差平均達0.22±0.36℃，溫差在0.1℃以上之牛隻在75.4％，經降溫牛隻後懷孕所需配種次數明顯改善，為2.5次對5.8次，夏季泌乳曲線下降幅度減緩，平均將食量增加2.79公斤混合料，每分鐘呼吸次數減少3.29次。
3. 觀察進口小型馬與迷你馬繁殖配種情形，小型馬胎距平均為504±1.6天，迷你馬平均胎距為634±1.8天。另觀察年度所產小型馬及迷你馬之初生體重分別為17.73±2.1及11.16±1.5公斤，體高分別為66.27±2.8及52.73±0.88公分，體長分別為48.11±1.6及38.5±8.25公分，發育較過去者良好。
4. 調查國內牛蹄病發現常見者為蹄葉炎、趾間皮炎及趾間蜂窩組織炎，而趾皮膚炎則尚未發現，且常見之蹄病多由管理狀況不佳所致，因此建議酪農注意牛舍清潔衛生及定期削蹄後，使原有的蹄病罹患率由7.5％降至3.3％。
5. 研究結果顯示在卵巢機能障礙牛隻之處理上，除需針對其種類選用不同之治療荷爾蒙製劑外，若能配合強肝劑類之藥品，可提高其療效，並增加其受胎率比率。
6. 研究動情素E2發現，正常分娩的乳牛，其分娩前血清中E2有上升的現象，在分娩前1週，如果E2值降低至20Pg/ml的母牛，發生胎盤滯留的機會則提高，作為評估分娩時胎盤是否發生滯留的指標。
7. 研究發現牛隻血液中Se濃度與胎衣滯留發生率有關，且注射Se針劑有助於提升Se濃度並降低胎衣滯留發生率。
8. 試驗研究結果顯示，乳牛日糧中添加微粒油脂2.5％，可提高乳量及乳脂率。
9. 進行牡梅花鹿對鈣與磷需求研究顯示，牡梅花鹿茸之鈣含量為22％(dry basis)或8.8％(fresh basis)，在鹿茸收割後，鈣之滯留率高達94％，而鈣之內源排出量為30.2mg/kg/day，維持所須之鈣為每日每公斤體重32mg，每生產1公斤鹿茸，每日需增加攝取飼糧之鈣約1.2g。梅花鹿鹿茸之磷含量為7％(dry basis)，鹿茸收割後，磷之滯留率為52％，每生產1公斤鹿茸，牡鹿除維持所需外，每日需增加攝取飼糧之磷0.8g。

(二)養豬

1. 比較使用各種工具對豬隻驅趕移動效率及屠肉品質之影響，結果顯示電擊棒驅趕之移動效率顯著優於手趕、木棒及木板驅趕方式，而電擊驅趕對於屠肉之電導度值、L值（亮度）、蒸煮失重、肌肉游離水有不良之影響。
2. 肉豬飼糧中添加200及400ppb有機態之砒碇甲酸鉻，可改善肉豬增重、飼料採食量及提升16-21％之腰眼面積，且背脂厚度也顯著下降。
3. 利用桃園種與杜洛克選育出具本土特性台灣黑豬品系I4代，並已引進梅山豬及盤克夏豬種，藉以提升繁殖效率及產肉性能。
4. 使用模組化豬舍與傳統式豬舍進行比較試驗，其結果顯示28日齡離乳時仔豬平均體重，模組化豬舍為9.015kg而模組化豬舍則為7.177kg兩處理組間差異顯著（p＜0.05）；在保育仔豬生長性能方面，56日齡時仔豬平均體重與平均飼料採食量分別為17.886、13.001kg及0.520、0.438兩處理組間差異極顯著（p＜0.01）。
5. 由豬骨萃取軟骨素之製造過程中不僅可獲得高湯，且由殘渣得到軟骨素為26.8％，最後殘渣骨可得到鈣粉，供給食品改良劑，用於肉丸魚丸等煉製品之增加彈性劑，亦可供作高鈣食品之用。

(三)家禽

1. 完成褐色菜鴨六代之選拔，其360日齡產蛋數達192-122枚，自初產至360日齡之產蛋率為79-91％，500日齡產蛋數為308-337枚，產蛋率為81-89％。
2. 大型番鴨頗受生產內外銷之鴨場歡迎。已完成第五代生長檢定，並已推廣10,094隻。
3. 土雞經各項繁殖性能測定結果，出產日齡為153-157天，初產體重為1,568-1,938公克，40週齡體重為1,680-2,022公克，40週齡之產蛋數為61-66個，其蛋重為44-47公克。以完成2元及4元雜交之田間試驗。

4. 建立產蛋鴨之各主要營養分需要量之研究，如能量、蛋白質、甲硫胺酸、亞麻仁油酸、離胺酸、維生素A、菸鹼酸、色胺酸、胱胺酸及組胺酸需要量之測定，供為菜鴨飼料營養分標準之參考用。
5. 已完成白番鴨蛋白質、熱能、需要量的研究。雛土番鴨初步試驗結果，鈉需要量為0.215％，氯需要量為0.134％，鉀為0.494％。已完成雛鵝對能量、蛋白質、甲硫胺酸、離胺酸、鈣、磷等需要量的研究。

(四)疾病監測

　　加強動物疾病的流行病學及病因調查研究外，著重動物疾病診斷技術的開發及改良，以期迅速確診，防止疾病蔓延，並投入動物用疫苗之開發，以利整體動物防疫。86年的主要成果如次：

1. 家禽方面：採得養鴨場25場，養鵝場18場之血清及肛門拭子試材各約1,200件，進行病原分離，其結果為自鴨分離到3株新城雞病（ND）病毒；至於雞傳染性華氏囊病（IBD）病毒與里奧病毒（reovirus）則未分離到。ND、IBD與里奧病毒抗體之測定結果為ND有低的陽性率，其它二種抗體則皆為陰性。從送檢土雞場病例87個，依其診斷結果，以大腸桿菌（E.coli)為最高，其次依序為傳染性華氏囊病及傳染性支氣管炎。另由11個放山雞群隨機採樣新鮮糞便檢體506個，寄生率以球蟲感染率(74.0%)為最高，其次依序為蛔蟲(7.7%)，毛細線蟲(1.9%)，絛蟲(0.65%)，盲腸蟲(0.6%)。在具有移行抗體之肉雞所做之試驗顯示高度免疫血清與某廠牌中間毒疫苗之混合接種較單獨接種該中間毒疫苗可引起較佳之抗體反應。
2. 豬隻方面：由5家曾經發生豬瘟場所收集到的320個母豬唾液樣品，320個血清樣品和85個糞便樣品，以RT-PCR方法檢測時，經以豬瘟廣泛性巢式引動子2次增幅後，唾液樣品中有35個(10.1%)，而糞便樣品中有17個(5.3%)呈現陽性反應，且均屬野外病毒。此結果顯示利用RT-PCR法可從唾液中檢出豬瘟病毒。經調查台灣地區引起保育階段豬隻死亡之疾病以呼吸系統為主，佔47.5%，其次為消化系統佔26.3%，多發性漿膜炎佔14.35%，其他細菌性或原蟲感染症或不明原因者有1.85%。口蹄疫爆發後哺乳仔豬之發生率及死亡率幾乎達100%。
3. 野生動物方面：以PCR技術進行野生動物結核病診斷及型別鑑定，確能改善和簡化傳統的方法，並可縮短操作時程及提高敏感性及特異性；並進一步作人型、牛型和其它型結核桿菌型別鑑定工作。針對台灣中部地區12個白鼻心養殖場，進行各場飼養情況所做的調查，於飼料分析上發現蛋白質佔20.59%、脂肪佔6.73%、鈣佔3.18%、磷佔1.74%、粗纖維佔2.33%及鹽份佔1.21%之飼料飼養狀況較為理想，疾病的發生仍以皮膚病居多。
4. 草食動物方面：養殖山羊寄生蟲感染的診斷方法上，以改良浮游法中加入比重1.2的糖水攪勻後靜置2小時所收集到的蟲卵及卵囊最多。自山羊腦中發現的指狀絲狀蟲幼蟲，經鑑定後確認為Setaria digitata而非Setaria marshalli或是Setaria cervi，此結果在臺灣係首次發現且發表者。南台灣地區乳牛生殖器疾病中常見者為卵巢囊腫。該問題可以PGF2α或GnRH予以治療。經問題之發現及問題之改善後,繁殖障礙發生率已由計畫執行前的33%降至計畫結束時之10%。
5. 水生動物方面：研究以有機磷劑用來防治魚類外部寄生蟲之結果發現，感染指環蟲和車輪蟲之吳郭魚以三氯松藥浴48小時者，以0.2 ppm治療組之存活率﹝60%﹞最高，未投藥組存活率則僅為25%。泰國蝦酵母菌感染者投與Encap免疫提升劑不同劑量經5日後，發現此試驗可提升細胞活性。25℃水溫組，以10倍Encap投與後，再以LD50菌攻擊後其活存率達83.3%；20℃水溫組，則活存率僅及50.0%。野外試驗結果顯示，水溫較高防治效果較佳。
6. 犬貓方面：從北部地區所收集到犬及貓各100個血清測試弓蟲病抗體力價結果，其陽性率各為8%及47%。另收集到100個人之血清，其抗體檢測結果，陽性率為7%(7人)，其中有3人是獸醫師，4人是護士，後者有3人家中養貓。都市的流浪犬貓除了會影響市容環境外，也是人畜共同傳染病的病媒。

(一)關鍵生物技術及產品開發

1. 作物基因轉移技術之開發應用
   自番茄及番椒病原真菌拮抗菌(Serratia marcescens)中選殖出幾丁質分解酵素基因，完成其DNA定序工作，測定在轉移植株的表現活性及對真菌病害之抗性。木瓜輪點病毒鞘蛋白基因轉移已獲得10個高度抗病之株系及1個具免疫性之株系18-0-19，正進行隔離田間試驗中，並已建立一套完善的組培技術，以生產推廣栽培所需基因轉移木瓜組培苗；在CMV鞘蛋白轉移方面，甜瓜已得到4個具抗病性且生長勢強的株系，另番茄得到13個抗病植株，進行子代篩選及隔離田間評估試驗中，其次進行喜姆比蘭嵌紋病毒(CyMV)及齒舌蘭輪斑病毒(ORSV)之鞘蛋白病毒基因選殖。蝴蝶蘭ACC synthase反義基因轉移成功獲得之株系進行隔離觀察。利用氮化鈉誘變得到對褐飛蝨具高度抗性之水稻同源突變品系，並獲得11個可能與抗性有關的RAPD片段，供進行抗褐飛蝨基因之選殖。甘薯胰蛋白酵素抑制基因轉移菸草，已確認對斜紋葉盜蟲、玉米穗蟲具良好抗蟲力。
2. 生物技術應用於種苗繁殖及品種改良
   研究改進培養介質使試管內誘導台農63號、台農66號、台農68號甘薯塊根形成率達96%以上；建立花生栽培種自交子房柄培養技術達到60%莢果形成率，且可獲得成熟種子；改善文心蘭、素心蘭、蝴蝶蘭微體繁殖及拖鞋蘭無菌播種繁殖技術，提昇我國花卉繁殖效率與種苗品質，另改進洋桔梗、星辰花組培苗健化技術，以紙巾、泥碳土、真珠石及傳統的洋菜為介質成活率高；建立唐菖蒲組織培養去毒化再生體系及茭白筍快速瓶苗繁殖系統，改進香蕉健康種苗育苗系統及木瓜兩性株側枝之腋芽微體扦插繁殖方法；利用細胞培養生產台灣紅豆杉之紫杉醇及其類似物，開發紅豆杉枝葉、細胞之紫杉醇及其類似物之萃取方法及HPLC分析方法；建立牛樟根蘗苗大量繁殖系統及紅檜試管繁殖系統，研發台灣扁柏莖頂、芽體製造膠囊型人工種苗技術，及台灣扁柏芽體、紅檜體胚製造粉圓型人工種苗技術。
3. 生物技術在水產養殖上之應用研究
   吳郭魚和虱目魚稚魚以抗凍蛋白（antifreeze protein）經由投餵與肛門注射方式處理，顯示抗凍蛋白對吳郭魚和虱目魚稚魚之低溫忍受力有顯著增強效果；吳郭魚由淡水轉移到300/00的海水中馴養，腦、肝、腸等器官熱休克蛋白含量，會隨著環境鹽度而改變，其中以腸的反應最為迅速與明顯，此熱休克蛋白的激發，有益魚體對刺激的適應；應用精子攜帶法電破轉殖含有鯉魚b -actin起動子和鱒魚生長激素基因之質體pAE6-rtGH於香魚精子，其轉殖效率達60%；建立蝦類白點症聚合酵素鏈反應診斷技術，進行預防白點症病毒蝦苗篩選、養成期間監測及預防，以有效遏止白點症病毒對養殖業之危害；開發愛德華氏菌、產氣單胞菌及滑走細菌等不活化混合菌苗，混於飼料製成顆粒浮水性飼料，以口服免疫方式連續餵飼14日，有顯著免疫防禦效果。
4. 家畜胚移置及生長激素應用之研究
   以酵素免疫技術分析荷蘭乳牛血清中乙種球蛋白之濃度，其中乳球蛋白之濃度與分娩後之產乳量成正比；將含有m-calpain antisense cDNA的體質以顯微注射的方法注入小鼠胚中，所獲得之基因轉殖鼠經生成性狀分析結果顯示，m-calpain antisense RNA確實會抑制肌肉中的calpain量，進而增加動物生長的速度；利用基因顯微注射技術產製16種基因轉殖小鼠，其中包括3種豬乳鐵蛋白基因（αLA-PLF；WAP-PLF；βcasein-PLF）轉殖小鼠，並已證實豬LF cDNA可表現於小鼠之乳腺；已建立聚合酵素連鎖反應（PCR）性鑑別方法，初步試驗冷凍融解胚亦可取細胞進行性鑑別，並產下與預測性別相同之雄性3胞胎雄牛；已技術推廣豬精子PHI（GPI）遺傳型檢測和豬輸卵管授精技術給業者。
5. 生物技術在食品上之應用研究
   利用分子育種技術開發紅麴菌種及醬油產業用特殊酵母菌並選殖出冰核形成菌，以生物工程方法生產食品級抗氧化劑及保健成份Monacolin K ，建立基因庫篩選出食品產業用酵素(L-麩胺酸氧化酵素、鹼性蛋白酵素、膠原蛋白酵素、鹼性脂肪酵素、生澱粉水解酵素、新型脂質酵素、嗜酸耐高溫葡萄糖異構酵素、耐熱性澱粉枝切酵素等)之基因並進行核酸序列之定序，以大腸桿菌為宿主細胞大量生產基因重組蛋白(L-麩胺酸氧化酵素、超氧歧化酵素、嗜酸耐高溫葡萄糖異構酵素、耐熱性澱粉枝切酵素等) ，以基因轉殖技術建立同時糖化及酒精發酵之新菌種。
6. 以酵素免疫技術分析荷蘭乳牛血清中乙種球蛋白之濃度，其中乳球蛋白之濃度與分娩後之產乳量成正比。
7. 將含有m-calpain antisense cDNA的體質以顯微注射的方法注入小鼠胚中，所獲得之基因轉殖鼠經生成性狀分析結果顯示，m-calpain antisense RNA確實會抑制肌肉中的calpain量，進而增加動物生長的速度。
8. 利用基因顯微注射技術產製16種基因轉殖小鼠，其中包括3種豬乳鐵蛋白基因（αLA-PLF；WAP-PLF；βcasein-PLF）轉殖小鼠，並已證實豬LF cDNA可表現於小鼠之乳腺。
9. 已建立聚合酵素連鎖反應（PCR）性鑑別方法，初步試驗冷凍融解胚亦可取細胞進行性鑑別，並產下與預測性別相同之雄性三胞胎雄牛。
10. 已技術推廣豬精子PHI（GPI）遺傳型檢測和豬輸卵管授精技術給業者。

(二)生物性農業資材及檢測技術

1. 應用生物技術研發植物病害快速偵測診斷與防治之策略應用

   (1)黑穗病菌偵測用核酸探針之製備與應用：利用真菌rDNA增幅研究上應用相當普遍的引子 (universal primer) ITS1與ITS4，可專一性檢測Ustilago esculenta，及其他Ustilago spp. 菌株，而對Alternaria等非黑穗病菌供測試真菌則均無反應，其對U. esculenta之偵測靈敏度可達1 pg，此專一性引子對只需1 mg鮮重之罹病組織即可測得病原之存在。在茭白筍帶菌苗之檢測應用及玉米、薏仁、甘蔗等重要危害性黑穗病菌檢定應用亦極具實用性。

   (2)荔枝露疫菌偵測用核酸探針之製備與應用：由荔枝露疫菌mtDNA選殖到較具專一性片段的選殖株ES6與25株荔枝露疫菌粒腺體核酸以點漬雜配法進行雜合反應，結果都有雜合交互作用。與17株Phytophthora菌株及Pythium splendens的全量核酸皆無雜合交互作用。其靈敏度可測到100 fg濃度的荔枝露疫菌粒腺體核酸。目前除繼續篩選更具專一性核酸探針外，並進行已篩探針之解序研究。

   (3)白絹病菌偵測用核酸探針之製備與應用：使用83株白絹病菌菌株之mtDNA進行專一性核酸片段之選殖。其和Sclerotium rolfsii、Sclerotinia sclerotium及Rhizoctonia solani之全DNA進行點漬雜配( dot hybridization )反應，顯示804021-53探針與大部份Sclerotium rolfsii之全DNA具有親合性。探針804021-53以點漬雜配法進行百合種球( 白雪內、外鱗片，白狐理內、外鱗片以及白雪、白狐理種球外土壤萃取液 )組織敏感性測定時，偵測有效濃度各為10-5 mg 、10-6mg 、10-6 mg 、10-7 mg。而以 RAPD 分析法，進行專一性片段篩選，得一600 bp 的專一性片段目前進行更具專一性核酸探針之篩選及解序、引子設計進行PCR微量菌體偵測法之開發。

   (4)立枯絲核菌(Rhizoctonia solani Kuhn) 偵測用核酸探針之製備與應用：對全省名地搜集之菌株，進行分群鑑定及病理特性之瞭解外，已進行質體狀核酸探針篩選，均可以很精確的鑑定群之分別，也曾使用到田間及植物組織偵測，均可有效偵測，其靈敏度以達fg程度, 目前擬進行田間偵測使用模擬條件。

   (5)灰黴病菌快速偵測之開發：目前篩選之核酸探針以BE83-8之敏感度最高可達10-5pg；BE83-4B則與所收集之B. cinere和B. ellipica菌株皆有反應。並以RAPD 分析法，進行專一性片段的篩選，以OPW-02 primer可測得一長為700 bp的專一性片段。

   (6)薑軟腐病病原菌偵測方法之研發與應用：針對田間調查收集16種61株腐霉病原菌中發現Pythium aphanidermatum比例最高。由粒線體DNA分析發現其多型性可以作為菌種鑑定的依據。由粒線體DNA選殖出具種專一性的探針，用點漬法可以測出105個游走胞子。將探針部份解序，設計專一性的引子，以Booster PCR的方法可以偵測田間作物及水耕營養液中的病原菌。

   (7)供交互保護用防治木瓜輪點病二代弱毒疫苗之開發：

   A. 繼上年度完成夏威夷株系 PRSV HA 生體外及生體內具感染力轉錄體，本年度已完成本省 PRSV YK具感染力轉錄體之構築，及具感染力質體之構築，即本省強系病毒株系已在分子層次上完全納入掌握。

   B. 另外也已完成不具病原性之 PRSV HA 5-1 全長度 cDNA 之構築，並且可產生具感染力之轉錄體，亦即輕症病毒株系已在分子層次上完全納入掌握。

   C. 在前年之 HA 及HA 5-1 之重組分析中已知 HA 5-1 950-3530 nt 為不具病原性之關鍵片段，目前已將此關鍵片段置換至本省嵌紋型株系PRSV YK 中，所得之重組病毒 PRSV YKHA51 經接種分析發現其病原性亦消失而成為無病徵感染，亦即是多年來所設定以遺傳工程技術將本省強系改變病源性使其為輕症病毒之目標已初步達成。

   (8)重要植物病毒與菌質體偵測用抗體與核酸探針及防治用疫苗之製備與應用：

   　　在植物病原細菌偵測及病害診斷之研究上已累積多年之研究經驗及成果, 包括針對 Xylella fastidiosa、Clavibacter xyli subsp. xyli、Xanthomonas albilineans等植物病原細菌已研製出偵測用之單元抗體或核酸探針。此外,在植物病原菌質體 (phytoplasmas)之研究上，本研究室已先後以基因選殖技術，針對本省之水稻黃萎病、花生簇葉病及甘藷簇葉病等菌質體之基因組 DNA (ginomic DNA) 選殖出具有專一性及敏感性之DNA探針(probe)及PCR引子。對這些細菌病害,均已完成偵測技術之建立。上述之研究結果及研究經驗應有助益於本計畫之順利執行。

   (9)重要植物病毒偵測用抗體與核酸探針之製備與應用：

   A. 參考目前已知10種 Potexvirus 病毒群之核酸序列，選取複製酵素基因同源性最高之2個區域，分別製備 cDNA 單株，並選殖於不同之轉錄載體，其中 pBaPol-3 和 pBaHel-3 為較合適之探針，因為此2探針僅含 5-10 個非病毒核酸序列之核酸。

   B. 利用 DIG 標定之非放射性核酸探針，在各種不同之鹽類濃度和洗條件下， pBaPol-3 和 pBaHel-3 對 Potexvirus 病毒群有廣泛性之偵測效果。如 potato virus X， bamboo mosaic virus (BaMV) 和cactus virus X (CVX) 均可偵測到 10 pg-100 ng 之病毒 RNA 之靈敏度，而由 BaMV 基因體製備之探針，對 CVX RNA 偵測之靈敏度最高。

   C. pBaPol-3 和 pBaHel-3 不僅對 Potexvirus 病毒群有廣泛性之偵測效果，對於含有 RNA 基因體之植物病毒，如 tobacco mosaic virus (TMV)，brome mosaic virus, papaya ringspot virus 亦有 0.1-10ng之靈敏度，而以對 TMV 之靈敏度最高，而pBaPol-3 之廣泛性較pBaHel-3 為高。

2. 生物性肥料之開發應用

   (1)已進行溶磷菌之分類及篩選，並明瞭其基因型特徵。確定溶磷菌Pseudomonas cepcia與Tari B9, B10為不同之菌屬，3種菌之溶磷機制均為酸解作用，惟其生理、生化代謝機制不同。同時已建立基因轉殖與追蹤之模式系統，可以泛寄主載體與染色體轉殖入方法行基因轉殖，並以螢光報導基因追蹤微生物之生態分布。

   (2)已將不同載體(Vector)藉電穿孔法送入測試菌株，建立重組基因在固氮菌之轉殖方法。以mini-Tn5轉位子及化學突變劑(NTG)對大豆根瘤菌SB651及B2菌株進行突變處理並篩選出喪失溶磷能力之變異株。以HPLC分析野生株及變異株之代謝產物，發現B2菌株及其變異株之代謝產物較為複雜，其代謝產物以citric acid及gluconic acid為主。

   (3)已順利將兩個起動子，選殖至可用以生產及分泌蛋白質分解酵素(Subtilisin)之質體上。此二質體在野生型B. subtilis DB2細胞及不含多種胞外蛋白分解酵素之B. subtilis DB430細胞中均能於菌株指數生長期中分泌蛋白質分解酵素。實驗結果顯示，含pWJ41質體的細胞較含pCC1質體之細胞具數倍分泌蛋白質分解酵素之能力。以含pWJ41質體的菌液處理有機質，可明顯增加其可溶性氮含量。

   (4)由果菜市場廢棄物堆肥中分離出之高溫放線菌中，選出纖維分解能力較高之分離株AM-A6為基因庫來源之供試菌株，而以纖維分解酵素活性最低之AP-A8菌株為宿主。將AM-A6菌株全部DNA抽出，並以各種內限制酵素作部分切割，進行各片斷之纖維素分解酵素活性比較，已獲得具纖維素分解活性之基因，並將之轉殖至高溫放線菌以提高其纖維分解能力。

3. 利用弓蟲B1 gene之四段oligonucleotides建立了高靈敏度及高特異性之nested PCR，以為偵測各種肉品內弓蟲核酸之用。
4. 對本省經常發生之牛流行熱開發聚合脢鏈反應快速診斷，可用於野外病例之確診。
5. 融合瘤及單株抗體儲存中心，目前已蒐集到及自行研製的融合瘤細胞株計有抗Pr 5株；抗TGE 4株；抗BVD 4株；抗IBD 3株；抗Rotavirus 4株；抗JE(日本腦炎) 2株；抗Parvovirus 1株；抗HC 1株；抗Adenovirus 1株；抗BEF 2株；抗EIA 1株；抗Flavivirus 1株；抗Influenza virus 4株；抗MD 1株；抗MH 1株；抗ND 1株；抗Reovirus 2株；抗不同白血球表面抗原16株；抗人肌蛋白1株；抗乳鐵蛋白1株；抗豬特定傳染病1株，共59株。單株抗體項數，除與融合瘤相同者外，尚有抗TGE 4株，抗HC 3株，抗ND 2株，抗牛冠狀病毒1株，抗大腸桿菌不同抗原4株，共計74株；以上蒐集儲存品皆可供學術界利用。

(三)加強推動農業生物技術產業

1. 為減少農藥之使用，積極推動生物製劑產業之發展，重點在開發病害防治用微生物與天然製劑，蟲害防治用微生物殺蟲劑，建立發酵量產技術及進行實用性評估，以進一步移轉商業生產。擬開發之對象微生物包括枯草桿菌(Bacillus subtilis)與放射菌(Streptomyces saraceticus)，可防治蝴蝶蘭、木瓜等之疫病，蔬菜等之立枯絲核病與鐮刀菌病害。病害防防治用微生物製劑研發方面，己建立枯草桿菌、放線菌2拮抗性微生物之量產製備流程，品管技術，所產製微生物製劑之病害防治與作物生長促進效果亦己經溫室及田間試驗證實，此兩微生物製劑開發工作所累積之技術經驗及產製產品，均已達可技術轉移產業界應用階段。
2. 蟲生真菌殺蟲劑之開發與利用之確立，已建立黑殭菌的基本培養條件及初步量產流程規範，品管測定技術也臻成熟，目前正在進行網室與田間試驗。在劑型研究方面，所製成之乳化劑，經初步試驗在短期內可保持孢子之活性。此外，採集並鑑定黑殭菌13株，白殭菌16株，綠殭菌25株，其產孢量、生長適溫及發芽速度和發芽率之資料收集已完成90%。白殭菌以ITS, 18S, P1, P3為引子經PCR-RFCP分析，可將之分成兩群；黑殭菌以18S, P1, P3為引子，經PCR-RFLP分析，可將之分作兩群；綠殭菌以18S，P1, P3為引子往PCR-RFLP分析發現菌株十分相似。綠殭菌在Ribose, D-Fructose, D-Mannose, D-Trehalose, D-Cellobiose, D-Glucose, D-Manitol存在時產孢量高。另發展出用太空包來生產綠殭菌之技術。
3. 蟲害防治用核多角體病毒之開發利用之研究，利用終點稀釋來篩選 AcMNPV-TWN4株系，選擇高感染力和高包涵體產量之5株系，目前結果顯示此5株病毒皆可用於將來大量生產之用。NTU-SL7B 細胞為 AcMNPV 高感性細胞株，利用稀釋法單株化細胞成功地獲得4株，在酯酵素測定下，並無明顯差異，但附著力、倍增時間及細胞形態上略有差異。目前之結果顯示當使用饋料批次之方法，以培養斜紋夜蛾細胞時，最高細胞密度已可達 1´ 107 cell/ml，這比傳統之批次培養方法，約增加40% 之多。並初步開發出Ex-Cell 401培養基，斜紋夜蛾細胞已於此培養基培養，生長超過1個月以上，其在此培養基之倍增時間約為 26-30小時，而病毒之產量亦可達 3.17´ 1010個/L。同時每個細胞所生產之 OB 約20個。甜菜夜蛾 NPV之量產方面的研究，已完成供應蟲隻大量飼育室，病毒接種培育室和冷凍儲藏庫裝置，有利於病毒之量產。飼料自動切割裝填系統，目前已完成試車。量產之 NPV可供應農民進行甜菜蛾防治。
4. 蟲生真菌孢子收集系統之建立與製劑配方之研製，以植物油可將蟲生真菌孢子分離，並可利用空套管式薄膜濃縮孢子。
5. 吳郭魚和虱目魚稚魚以抗凍蛋白（antifreeze protein）經由投餵與肛門注射方式處理，顯示抗凍蛋白對吳郭魚和虱目魚稚魚之低溫忍受力有顯著增強效果。
6. 吳郭魚由淡水轉移到30%的海水中馴養，腦、肝、腸等器官熱休克蛋白含量，會隨著環境鹽度而改變，其中以腸的反應最為迅速與明顯，此熱休克蛋白的激發，有益魚體對刺激的適應。
7. 應用精子攜帶法電破轉殖含有鯉魚b -actin起動子和鱒魚生長激素基因之質體pAE6-rtGH於香魚精子，其轉殖效率達60%。
8. 建立蝦類白點症聚合酵素鏈反應診斷技術，進行預防白點症病毒蝦苗篩選、養成期間監測及預防，以有效遏止白點症病毒對養殖業之危害。
9. 開發愛德華氏菌、產氣單胞菌及滑走細菌等不活化混合菌苗，混於飼料製成顆粒浮水性飼料，以口服免疫方式連續餵飼14日，有顯著免疫防禦效果。
10. 豬假性狂犬病gE缺損不活化疫苗之研發﹐gE缺損病毒之培養增殖﹐其力價可達108.0TCID50/ML以上﹐經BEI不活化處理以礦物油為佐劑製成不活化疫苗﹐經無菌及安全試驗均合格﹐並通過家兔之效力檢定。於雲林縣下實施1,200頭保育豬之免疫試驗效果良好。本製造技術已移轉高雄縣農會生物製藥廠。
11. 豬小病毒不活化疫苗之開發：本疫苗已開發完成﹐並由合作生物藥品廠(台畜)派員到省家衛所研習製造技術﹐並分讓種毒與細胞並由合作生物藥品廠製造不活化疫苗二批﹐正展開田間試驗中。
12. 豬博德氏菌﹑巴氏桿菌﹑放線桿菌﹑大腸桿菌﹑沙氏桿菌及假性狂犬病不活化混合菌(疫)苗之研製與田間試驗工作﹐已完成實驗室之安全及效力試驗工作﹐俟順利完成後即可移轉合作之民營製造廠。
13. 豬假性狂犬病gI及TK基因缺損活毒疫苗之開發：豬假性狂犬病gI/TK活毒疫苗已完成安全效力試驗﹑毒力迴歸試驗及田間應用試驗均獲良好之成績﹐已完成商品化之各項應用研究﹐並已由合作廠商高生公司申請查驗登記。
14. 雞甘保羅﹑新城雞病﹑產蛋下降症侯群﹑傳染性支氣管炎﹑傳染性可利查和大腸桿菌不活化疫苗的研發及成品化試驗﹐目前本6合1不活化油質混合疫苗已完成各項品管工作﹐已由高生公司申請委託試驗中。

(一)農業生產自動化

1. 辦理農會水稻收穫後乾燥作業自動化規劃﹐編印技術手冊﹐對農會操作人員進行訓練，並完成八德市﹑苑裡鎮﹑五結鄉﹑池上鄉﹑六甲鄉﹑南投市﹑關山鎮﹑玉溪地區﹑冬山鄉﹑草屯鎮等農會收購濕穀及乾燥中心之週邊設備之自動化。及新市鄉﹑蘆竹鄉等農會之礱穀及集塵作業系統之相關自動化設備，經由自動化設備之應用，每家農會每期作可節省作業成本約200萬元。
2. 引進連續光電式茶葉自動精製選別機﹐裝設於名間及鹿谷鄉農會﹐使茶葉之選別及包裝工作達自動化作業之程度。
3. 完成雙排針真空播種機之開發，有效提高播種效率，並輔導後龍﹑大園﹑元長﹑學甲﹑埔里﹑溪湖﹑玉里﹑民雄﹑褒忠﹑員林﹑北斗﹑西螺﹑阿蓮﹑大村﹑里港﹑芳苑﹑土庫﹑太保﹑六腳等19處自動化蔬菜育苗場進行自動化穴盤育苗﹐每年生產健康穴盤苗總數達2億株7千萬株。
4. 蔬菜移植機方面﹐研製全自動及半自動移植機﹐後者並已開始商品化。86年度完成1部雙行自走式移植機。
5. 建立自動化組織培養室1棟﹐空間達245平方米﹐屬正壓過濾﹐具斷電發電機等設備﹐可在無菌下操作瓶苗之培育作業。購置操作台3部﹐殺菌釜大小各1台。另完成兩套機器人系統﹐可用於示範組織培養苗扦插作業自動化。
6. 完成12處國內蓬架式葡萄園及蔬菜園示範點﹐積極進行示範工作。並完成方型鍍鋅鋼管結構內自動噴藥裝置﹐廣被農民採用﹐目前共裝設於30棟溫室進行試驗。可節省人工8倍。
7. 利用感應資訊之處理及控制系統中以控制梨及枇杷園灌溉作業﹐至今在全台設立示範點14處。

(二)漁業生產自動化

1. 辦理鮪延繩釣作業及航行自動化訓練共3期143人次，主副機自動控制訓練6期115人次，新式魷釣機訓練4期36人次。並完成近海鮪延繩釣作業自動化系統引進漁獲性能分析及漁海況資訊自動監控系統之硬體整合與軟體功能之提昇。推廣漁船機艙安全自動監控系統2套。
2. 改進定置網魚族入網監視處理技術，設計一長12公尺橡膠氣浮帶，繫於第二登網口下緣，以電器-氣壓控制系統啟動充氣，達到登網口遮斷封網之效果。進行作業船採用噴水式推進器研究，以改進操控之方便性、安全性，並降低傳統作業船引擎之震動與噪音。推廣定置漁業作業船自動化設備(油壓夾具、吊車)3套。
3. 研究設計魷魚漁獲冷凍後自動脫盤裝置，並委託漁機製造廠製造雛形機。研發魷釣船上魷魚自動分級系統雛形機，可將魷魚分為5級。
4. 開發自動化超集約養鰻系統周邊設備，建立養殖場屋頂塗佈隔熱漆及裝設免動力旋轉渦輪機，另安裝冰水機等降溫處理模式。完成水質監控系統架構之整合與溶氧感測器感測頭本土化開發需求性之評估。公開甄選與補助自動化超集約養殖場1場，及辦理自動化超集約養鰻場人員訓練與定期現場輔導。
5. 研發室內自動養蝦系統，建立二層三組室內立體自動養蝦系統模式，草蝦養殖試驗結果單位面積可達傳統養殖之9倍產量。改善系統循環水微生物過濾裝置，較傳統養蝦節約85％用水量。
6. 完成水陸兩用動力船加裝文蛤採收機之開發，可較傳統採收方式節省人力50％。完成蜆分級機與蜆收穫後處理自動化系統之改進。完成鰻魚分級機商品機之開發，分級能力每小時5公噸以上。

(三)畜牧生產自動化

1. 完成小型香腸式青貯機之測試，測試結果顯示對不同之芻料與農副產物的青貯品質均達好的標準，青貯作業成本每公噸為119.4元，青貯損失率僅在0.3～1.0％間僅青貯槽的50分之1，並已建立5處示範推廣點。
2. 牧草收穫機可在田間將盤固草切短至17到40mm後送回牛舍，每公頃作業時間需1.0到1.5小時。
3. 自行研發之機械式與電牧式兩型自動趕牛器、搾乳室自動柵門、乳房自動清洗噴頭等已能由國內廠商生產供應酪農戶，並且達到預期自動化節省勞力的效果。另機械氣壓感應式乳杯自動脫落器已與中興大學農機系合作研製完成，經測試效果良好，電子式乳杯自動脫落器原形機亦製作完成。
4. 引進之乳房炎乳汁自動偵測系統已裝設於興大畜牧場，正作系統調整、數據收集與性能測試中，本系統除了將可提供研發乳房炎偵測系統所需的結構原理之研究與資料之收集，並可作教學與示範推廣。另一型電子感應式乳杯自動脫落器原形機亦由新竹畜試分所製作完成。
5. 完成水簾式雞舍空氣污染防治系統各部位如空氣過濾系統、空氣過濾槽、過濾槽灑水系統、循環過濾儲水槽及其整體過濾流程之圖面設計，且該系統已獲屏東縣雞農同意安裝在其新蓋之2樓水簾式雞舍之第1樓層中測試。
6. 為研製適用於各式雞場的排泄物自動集收系統，且兼具調整水份之功能，已完成雛型機的製作，並於自動化展呈現初步操作的情況，且已進行田間試驗。
7. 完成本省10個鄉鎮都市氣象資料之調查與工具軟體之發展，另完成本省現有乳牛舍環控系統之調查，畜舍結構對室內輻射環境之影響的初步探討，降溫設備投資極限之理論推導，降溫系統之安裝與降溫性能測試，並建立中部地區的牛舍降溫示範點。
8. 採用薄防水布料縫製發情偵測訊號感測組套袋(約為A4尺寸)，經測試45天以上，不傷害牛隻皮膚，惟感測器厚度與套袋設計仍待改進。而其田間測試結果顯示：經內泌素處理之母牛，致騎乘或被騎乘頻率增加，系統仍能正確顯示開始被騎乘時間，且供試母牛全數有站立發情現象。
9. 完成符合ISO9000標準之畜禽無線電識別系統微晶片詢答器技術開發，無線電辨識系統相容性讀取器之評估,和畜禽無線電辨識系統讀取器模擬研究及注射針頭之製作。初步製造1萬片適用於畜犬之辨識晶片，試植結果無不良反應，且讀取率達100%。

(四)農產運銷服務業自動化

1. 推動批發市場建立電腦拍賣

   (1)完成無線式電腦拍賣鐘系統在果菜拍賣作業上之應用模式，並落實應用在台北農產公司及三重果菜市場，頗受供銷雙方好評。

   (2)在資策會科展中心設置無線式電腦拍賣鐘系統展示站，向各界展示資訊科技在農業上之應用成果。

   (3)規劃嘉義魚市場、台中果菜市場測試並導入無線式電腦拍賣鐘系統之作業程序。

2. 建立運銷業務電腦管理系統

   (1)輔導台北農產、漁產公司更新帳務處理電腦設備，建立資料庫應用模式，並增加批發市場品質查報、交易資訊傳真及語音查詢等服務功能。

   (2)開發魚市場通用電腦軟體，並應用在新營、斗南等13個中小型魚市場，縮短交易資料處理時間。

   (3)開發完成合作社場運銷業務電腦軟體，並應用在漢光、饒平、埔里等果菜及花卉合作社。由於該軟體功能良好，本年輔導20個合作社場導入應用。

3. 推動農產品物流作業

   (1)輔導彰化魚市場建立魚貨裝卸及搬運電動化、棧板化作業，提高作業效率。

   (2)輔導台北、新竹、嘉義等魚市場設置錄影監視設備，改善魚市場經營管理。

   (3)辦理電子商務技術在農產運銷應用研討會，規劃未來推動方向。

(五)推動配合措施

1. 辦理農業自動化技術服務團︰舉辦講習會、訓練班、演講會、示範觀摩會及研討會等86年度計65場次共2,549人次參加，對加強農業自動化觀念及成果宣導，以及成果之落實推廣助益極大。另協助規劃及技術諮詢案件計212件及技術輔導案件計109件，審核自動化設備申貸案件計28件，核貸金額6,150萬元。
2. 完成「農業自動化電腦語音自動化傳真回覆系統」及「農業自動化全球資訊首頁」設置，並繼續編印農業自動化叢書，累計至86年度已完成8輯，提供計畫執行單位與相關產官學研單位參考。另整合國內外農業相關之自動化文獻，並以季刊方式出版「農漁牧產業自動化專題選粹」刊物，每年發刊4期，提供迅速、新穎的資訊服務。
3. 完成農資中心之「全國農業資訊系統」在加值網路上之連線，農業機械化與自動化資訊網路亦架設於本會整合之BBS資訊系統，並繼續充實資料，提供相關單位廣泛之資訊服務。
4. 辦理「園藝生產自動化技術研習班」、「應用園產養豬飼餵自動化系統」、「低溫單元操作技術」及「農業生產自動化及微電腦監控人才訓練」等訓練班，共訓練200餘人次。
5. 完成農業自動化技術宣導錄影帶之編輯製作，包括稻米加工作業、蔬菜育苗作業、蝴蝶蘭產期調整栽培、果園管路施藥、芽菜生產與綠化、自動化超集約鰻魚養殖、定置漁業作業、完全混合日糧（TMR）餵飼、牛乳收穫、家畜廢水處理、果菜電腦拍賣及水果包裝處理中心作業等12項自動化技術錄影帶拍攝製作。

(一)毛豬產業發展模式之研究

　　本研究以一般均衡模式分析毛豬口蹄疫發生及開放進口對毛豬產業及其他相關產業之影響，並探討毛豬產業未來發展方向。研究結果並指出，在毛豬飼養生產結構方面，過去係以外銷市場持續成長的帶動上，生產結構的調整以平均成本為主要影響因素，乃使養豬場朝向企業化大規模且一貫化之經營型態集中。毛豬口蹄疫發生致出口停止後，預期產地毛豬價格波動相對增加，故養豬場之經營除考慮平均成本外，價格風險將同時影響其飼養規模，因此，平均飼養規模持續擴大的趨勢將受到限制。

(二)坡地農業對環境之影響及轉型經營之研究

　　以蘭陽地區高冷蔬菜產業個案為研究對象，調查經營現況對環境之影響及探討未來轉型經營之調整方向。研究結果發現高冷蔬菜的生產對環境之影響主要來自肥料、農藥的施用以及產業道路的開闢。其影響程度則視坡度、土質等而定，坡度較陡，土壤之土石粒愈多者，對環境之影響愈大。受訪農戶對於轉型經營之看法，包括考慮至別處種植、希望政府輔導就業、觀光市場之開闢如楓樹林、留在原地種植、改變作物種類。

(三)降低毛豬生產成本計畫成效之評估

　　輔導毛豬示範農戶記帳，建立完整收益與成本記錄，評估降低生產成本計畫之成效及經營效率之改進方向。評估結果發現：經技術服務團五年多來之輔導，172戶之毛豬示範戶之85年直接生產成本經物價指數調整後，較80年下降7.12％；同時示範戶亦肯定技術服務團、行政單位降低成本計畫之規劃及輔導，使其毛豬增養、管理技術、飼養型態等均有提昇，亦表示感謝。此外，本計畫選取兩位示範戶做五管（生產、銷售、財物、研發、人事）分析，可作為經營推廣之示範。

(四)農業勞動力之綜合研究

　　研究結果預測民國85~100年農業勞動供給和需求均呈現下降趨勢，其中供給減少的速度將大於需求。若以農業就業比例佔總就業人口之5％規劃，至民國99年農業勞動供給為57.8萬人，如以民國84年相較，尚須減少37.6萬農業勞動力，亦即每年必須減少2.7萬人，方能達成目標。產業就業人數結構方面，服務業所佔比率逐年增加，建議農民以營造業、餐旅業、商品買賣業及運輸業為外移就業主要目標。未來農業勞動發展策略重點為：妥善研擬農業勞動發展規劃；培育青年農民，加強農業職校教育功能；加強農業勞動者之經營能力；研擬農業勞動離農或轉業辦法。

(五)台灣農業政策管理系統之開發與維護

　　維護及擴建過去3年所建立之農業政策管理系統，包括建立漁業、林業、園藝等3個子系統，對重大農業情勢與政策進行模擬分析。漁業部門模型係以數學規劃方法及漁業部門的投入產出關係為基本架構，包括3大類型漁業共38種漁產品及要素市場。模擬分析包括利用漁業部門模型模擬加入WTO之進口增加，政策調整、入漁費上升等對國內整體漁業結構之影響；及利用農林雙部門模型估算造林與改善空氣品質之關係。

(六)日本重要農產品進口管理制度之研究

　　探討烏拉圭回合協議後，日本之重要農產品進口管理制度，包括農畜產振興事業團所主導的畜產品進口及食糧廳所主導的米、麥、澱粉類等農產品的進口。其中乳製品由進口限制改為關稅化，適用特別防衛措施；豬肉仍延用差額關稅制度，為從量稅與從價稅併用的關稅制度，適用一般防衛措施及特別防衛措施；稻米進口維持由食糧廳一元化進口體制的國家貿易，並課徵每公斤292日圓為上限的買賣價差，進口方式除一般進口外，還有買賣同時招標制度(SBS)。日本之做法可供我國因應加入WTO，研擬相關農產品的開放進口決策參考，俾能活用各種貿易措施，確保國內相關產業的發展。

(七)國際環保公約與我國農業貿易政策之研究

　　分析比較國際貿易組織與環保公約的內容及爭端解決機制，並展望分析未來有關貿易與環境之議題。研究結論指出：國際環保公約，目前規範的範圍已由產品本身的環保，進而擴大到要求製程與生產方法的環保；在我國加入WTO後，一旦面臨他國對境外環境衝擊片面採取貿易措施時，可藉貿易組織原則對抗他國對環境原則的濫用，以維護我國應有的權益，另也可以GATT第二十條【豁免條款】之保護境內人類與動植物生命、健康為理由，禁止破壞我國生態與帶疫的農產品進口；遵守國際環保公約，可以避免貿易制裁、也可以禁止危害我境內生態的產品進口，長期下有助於提昇我國農業競爭力；為因應目前國際環保與品質認證標章體系的潮流，農政單位應積極輔導農業廠商與同業團體通過國內外環保與品質認證；未來農業發展，應走向農業、環保、生物科技三個產業的整合。

(八)建立糧食生產與環境資料庫

　　配合亞太經濟合作理事會（APEC）之糧食特別工作小組之「糧食與環境」行動計畫之第一年工作計畫，建立糧食與環境資料庫，並將資料庫建立成附有使用手冊之光碟檔案，俾各會員體透過該資料庫之使用能增強其對APEC區內糧食生產與環境之影響的暸解。資料庫內容包括：經濟體指標(經濟發展狀況之基本指標，包括人口、GNP及GDP，GDP之支出分配以及價格指數等)，糧食生產(糧食作物之產出與投入資料，包括糧